Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.1022 D4Ucla1DNA segment, Chr 4, University of California at Los Angeles 1 4  4 78.3 cM  28148 
 Mm.1022 Cdc42cell division cycle 42 homolog (S. cerevisiae) 4  4 66.75 cM  12540 
 Gene Ontology actin filament organization | filopodium | GTP binding | GTPase activity | GTPase activity | protein binding | Rho protein signal transduction | small GTPase mediated signal transduction
 Human Homolog CDC42[cell division cycle 42 (GTP binding protein, 25kDa)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 106 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
GGGATCAGTC (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
27.80.0278
Cb medulloblastomaAAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
230.023
P8 GC+1d cultureAAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
TAAGAAAATG (3)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
TTGGTTAAAA (2)
37.60.0376
P8 GC+SHH+1d cultureAAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
CTTGTATTGA (2)
GGGATCAGTC (2)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
TTGGTTAAAA (2)
17.80.0178
3T3 fibroblastsTGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
24.50.0245
E15 cortexGGGATCAGTC (2)
TATCTGCTTA (2)
9.80.0098
P1 cortexAAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
GGGTGGGGAG (2)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TTGGTTAAAA (2)
40.80.0408
HypothalamusAAATGAAATA (3)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
TTGGTTAAAA (2)
19.80.0198
E12.5 retinaAAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
GGGATCAGTC (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
15.10.0151
E14.5 retinaAAATGAAATA (3)
ATTCTTTATA (3)
GGGTGGGGAG (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
30.90.0309
E16.5 retinaAAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
TAAGAAAATG (3)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
28.90.0289
E18.5 retinaAAATGAAATA (3)
ATTCTTTATA (3)
CTTGTATTGA (2)
GGGATCAGTC (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
21.70.0217
P0.5 retinaATTCTTTATA (3)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
11.80.0118
P2.5 retinaATTCTTTATA (3)
GGGTGGGGAG (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
19.40.0194
P4.5 retinaAAATGAAATA (3)
ATTCTTTATA (3)
GGGATCAGTC (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
180.018
P6.5 retinaAAATGAAATA (3)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
11.70.0117
P10.5 crx- retinaAAATGAAATA (3)
ATTCTTTATA (3)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
29.80.0298
P10.5 crx+ retinaAAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
11.50.0115
Adult retinalATTCTTTATA (3)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
5.70.0057
ONLAAATGAAATA (3)
ATTCTTTATA (3)
TCTCCTGATA (2)
TTGGTTAAAA (2)
19.10.0191