Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.10709 4930589O11RikRIKEN cDNA 4930589O11 gene 5    78214 
 Mm.10709 1110003E01RikRIKEN cDNA 1110003E01 gene 5    68552 
 Mm.10709 5430439C17RikRIKEN cDNA 5430439C17 gene 5    71403 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 101 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
GAATTCTCCA
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
24.40.0244
Cb medulloblastomaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
TTATTTAAAG (3)
TTTATTTAAA (3)
20.70.0207
P8 GC+1d cultureAGCTTCTAGA (4)
ATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
CCAAACAAAT (5)
TCAGCTGGGA (2)
18.20.0182
P8 GC+SHH+1d cultureATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
CCAAACAAAT (5)
TGCCACCACC (2)
TTATTTAAAG (3)
TTTATTTAAA (3)
280.028
3T3 fibroblastsGTCATAGCTG (2)
10.50.0105
E15 cortexGAATTCTCCA
GTCATAGCTG (2)
TGCCACCACC (2)
19.70.0197
P1 cortexAGAGGCTCCA
TTTATTTAAA (3)
90.009
HypothalamusATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
CCAAACAAAT (5)
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
TTATTTAAAG (3)
TTTATTTAAA (3)
28.80.0288
E12.5 retinaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
CCAAACAAAT (5)
TCAGCTGGGA (2)
9.50.0095
E14.5 retinaATTGATTAAA (4)
TGCCACCACC (2)
TTATTTAAAG (3)
200.02
E16.5 retinaAGCTTCTAGA (4)
ATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
TCAGCTGGGA (2)
TTTATTTAAA (3)
180.018
E18.5 retinaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
TGCCACCACC (2)
TTATTTAAAG (3)
TTTATTTAAA (3)
38.10.0381
P0.5 retinaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
GTCATAGCTG (2)
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
19.60.0196
P2.5 retinaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
CTTCCACTTA (4)
GTCATAGCTG (2)
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
31.80.0318
P4.5 retinaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
GTCATAGCTG (2)
TCAGCTGGGA (2)
TTATTTAAAG (3)
TTTATTTAAA (3)
25.70.0257
P6.5 retinaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
CCAAACAAAT (5)
GTCATAGCTG (2)
TCAGCTGGGA (2)
33.40.0334
P10.5 crx- retinaAGCTTCTAGA (4)
ATTGATTAAA (4)
CCAAACAAAT (5)
GAATTCTCCA
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
TTTATTTAAA (3)
27.90.0279
P10.5 crx+ retinaATTGATTAAA (4)
ATTGATTAAT (4)
CCAAACAAAT (5)
CTTCCACTTA (4)
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
230.023
Adult retinalATTGATTAAA (4)
CCAAACAAAT (5)
GAATTCTCCA
GTCATAGCTG (2)
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
TTATTTAAAG (3)
22.40.0224
ONLAGAGGCTCCA
ATTGATTAAA (4)
CTTCCACTTA (4)
GAATTCTCCA
GTCATAGCTG (2)
TCAGCTGGGA (2)
TGCCACCACC (2)
32.40.0324