Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.12145	Rbbp4	retinoblastoma binding protein 4	4	4	19646
Gene Ontology	cell cycle | chromatin remodeling | DNA repair | DNA replication | nucleus | NuRD complex | protein binding | regulation of transcription, DNA-dependent
Human Homolog	RBBP4[retinoblastoma binding protein 4]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 132 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CAAGTGTGGC (3) CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GCTGACAAGG GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 123.9 0.1239 Cb medulloblastoma AAACAAAAAA (3) AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 154.8 0.1548 P8 GC+1d culture AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CAAGTGTGGC (3) GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 114.2 0.1142 P8 GC+SHH+1d culture AATATGGATG (4) ACTAACTGTG GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 165.1 0.1651 3T3 fibroblasts AAGGGTAGCT GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 266.3 0.2663 E15 cortex GCTGACAAGG GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 291.9 0.2919 P1 cortex AATATGGATG (4) GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 154.6 0.1546 Hypothalamus AAACAAAAAA (3) AATATGGATG (4) ACTAACTGTG GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG TTTATGTTTA (2) 389.4 0.3894 E12.5 retina AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CAAGTGTGGC (3) CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG TTTATGTTTA (2) 255.5 0.2555 E14.5 retina AAACAAAAAA (3) AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG TTTATGTTTA (2) 1053 1.053 E16.5 retina AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG TTTATGTTTA (2) 867.4 0.8674 E18.5 retina AAACAAAAAA (3) ACTAACTGGG ACTAACTGTG CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG TTTATGTTTA (2) 380.1 0.3801 P0.5 retina AAGGGTAGCT ACTAACTGTG CAAGTGTGGC (3) GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 282.6 0.2826 P2.5 retina AAACAAAAAA (3) AAGGGTAGCT AATATGGATG (4) ACTAACTGGG ACTAACTGTG CAAGTGTGGC (3) GAATAAATTG (2) GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 220 0.22 P4.5 retina AAACAAAAAA (3) AATATGGATG (4) ACTAACTGTG GAATAAATTG (2) GAGAGTAACA GCTGACAGTG (2) GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 235.8 0.2358 P6.5 retina AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GCTGACAGTG (2) GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 203.4 0.2034 P10.5 crx- retina AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GCTGACAGTG (2) GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 354.8 0.3548 P10.5 crx+ retina AATATGGATG (4) ACTAACTGTG GAGAGTAACA GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 173.1 0.1731 Adult retinal AATATGGATG (4) ACTAACTGTG CTGGTGGGTT GAGAGTAACA GCTGACAGTG (2) GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG 276 0.276 ONL AATATGGATG (4) ACTAACTGTG GAGAGTAACA GCTGACAGTG (2) GTGGTTCACA (2) TGGTTGCTGG TTTATGTTTA (2) 457.8 0.4578