Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.159684 Tmpothymopoietin 10  10 C2 (10 49.0 cM)  21917 
 Mm.159684 5830485P09RikRIKEN cDNA 5830485P09 gene 10    76121 
 Mm.159684 AW547477expressed sequence AW547477 10    103472 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 84 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCATTTTTTA (5)
GAAGTCCTAC (3)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
TGGATAAAAA (4)
TTTTGCCTTA (3)
52.20.0522
Cb medulloblastomaCCATTTTTTA (5)
TACCTGTGAA (4)
TGGATAAAAA (4)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureCCATTTTTTA (5)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
19.40.0194
P8 GC+SHH+1d cultureCCATTTTTTA (5)
GAAGTCCTAC (3)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
TGGATAAAAA (4)
TGGCTCATCT (4)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
44.50.0445
3T3 fibroblastsCCATTTTTTA (5)
GACACCGAGA (3)
70.007
E15 cortexGTGATGTAAT (3)
9.90.0099
HypothalamusGTGATGTAAT (3)
TGGCTCATCT (4)
3.60.0036
E12.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GAAGTCCTAC (3)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TAGAAAATAA (3)
TATGGCTTAG (3)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
56.60.0566
E14.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
32.70.0327
E16.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GACACCGAGA (3)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TAGAAAATAA (3)
TTCTGGTCTC (3)
TTTTGCCTTA (3)
32.50.0325
E18.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TAGAAAATAA (3)
TATGGCTTAG (3)
TGGATAAAAA (4)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
50.80.0508
P0.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TTCTGGTCTC (3)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
570.057
P2.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GAAGTCCTAC (3)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TTTTACCTGG (3)
38.90.0389
P4.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
TGGCTCATCT (4)
27.80.0278
P6.5 retinaCCATTTTTTA (5)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
11.70.0117
P10.5 crx- retinaGTGATGTAAT (3)
TATGGTTAGA (3)
9.30.0093
P10.5 crx+ retinaGTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TATGGTTAGA (3)
11.50.0115
Adult retinalCCATTTTTTA (5)
TACCTGTGAA (4)
3.80.0038
ONLGTGATGTAAT (3)
TATGGTTAGA (3)
7.60.0076