Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.16775	Rps24	ribosomal protein S24	16		20088
Gene Ontology	cytosolic small ribosomal subunit (sensu Eukarya) | intracellular | protein biosynthesis | ribosome | ribosome biogenesis | RNA binding | structural constituent of ribosome
Human Homolog	RPS24[ribosomal protein S24]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 78 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACCAACCGTC (2) CAGAACAAGT (2) CCTTTATGAG GCCTTTATGA GCGAAGGCCA TATGGCCTTT (2) 184.4 0.1844 Cb medulloblastoma ACCAACCGTC (2) GCCTTTATGA 57.8 0.0578 P8 GC+1d culture CCAAAGCCAG GCCTTTATGA 95.8 0.0958 P8 GC+SHH+1d culture ACTAGTGCTT (4) CCAAAGCCAG GCCTTTATGA GGCAAAGTGT (5) TATGGCCTTT (2) TCTTGCCAGT 105.5 0.1055 3T3 fibroblasts CCAAAGCCAG GCCTTTATGA 94.6 0.0946 E15 cortex GCCTTTATGA 59.4 0.0594 P1 cortex CCTTTATGAG GCCTTTATGA 68.1 0.0681 Hypothalamus GCCTTTATGA TATGGCCTTT (2) TCTTGCCAGT TGGTAATCAG TTGGTGCTGG (3) 32.6 0.0326 E12.5 retina ACTAGTGCTT (4) CAAGAACAGA (3) CCTTTATGAG GCCTTTATGA TATGGCCTTT (2) TGGTAATCAG 249.8 0.2498 E14.5 retina CCAAAGCCAG GCCTTTATGA TCTTGCCAGT TTGGTGCTGG (3) 87.4 0.0874 E16.5 retina CAAGAACAGA (3) CCAAAGCCAG GCCTTTATGA GGCAAAGTGT (5) TTGGTGCTGG (3) 92.3 0.0923 E18.5 retina GCCTTTATGA GGCAAAGTGT (5) TCTTGCCAGT TGGTAATCAG 70.9 0.0709 P0.5 retina ACCAACCGTC (2) CCAAAGCCAG CCTTTATGAG GCCTTTATGA GCGAAGGCCA TACTTCAGAT 174.7 0.1747 P2.5 retina GCCTTTATGA GCGAAGGCCA TTGGTGCTGG (3) 56.4 0.0564 P4.5 retina ACTAGTGCTT (4) CAAGAACAGA (3) GCCTTTATGA TGGTAATCAG TTGGTGCTGG (3) 57.5 0.0575 P6.5 retina GCCTTTATGA TACTTCAGAT TGGTAATCAG TTGGTGCTGG (3) 66.8 0.0668 P10.5 crx- retina ACCAACCGTC (2) CCAAAGCCAG GCCTTTATGA TACTTCAGAT TATGGCCTTT (2) 180.2 0.1802 P10.5 crx+ retina GCCTTTATGA TACTTCAGAT TATGGCCTTT (2) 48 0.048 Adult retinal GCCTTTATGA GCGAAGGCCA TATGGCCTTT (2) 57.5 0.0575 ONL GCCTTTATGA TATGGCCTTT (2) TCTTGCCAGT TTGGTGCTGG (3) 72.8 0.0728