Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.16775	Rps24	ribosomal protein S24	16		20088
Gene Ontology	cytosolic small ribosomal subunit (sensu Eukarya) | intracellular | protein biosynthesis | ribosome | ribosome biogenesis | RNA binding | structural constituent of ribosome
Human Homolog	RPS24[ribosomal protein S24]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 224 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACCAACCGTC (2) AGAGCGAAGT (3) AGTTACTTTT (3) ATGGCTACGG CAGAACAAGT (2) CCTTTATGAG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GCGAAGGCCA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TATGGCCTTT (2) TCTTGGGGTC TGTCCTTCTT 342.6 0.3426 Cb medulloblastoma ACCAACCGTC (2) AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TCTTGGGGTC 210.4 0.2104 P8 GC+1d culture AACTTCCTGT AAGTGAGAGG AGAGCGAAGT (3) AGTGAACAAT (2) ATGGCTACGG CCAAAGCCAG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TCTTGGGGTC TGTCCTTCTT 249.8 0.2498 P8 GC+SHH+1d culture AACTTCCTGT ACTAGTGCTT (4) AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG CAGAAGAAGT CCAAAGCCAG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GCGGCGGTTC (2) GGCAAAGTGT (5) GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TATGGCCTTT (2) TCTTGCCAGT TCTTGGGGTC TGTCCTTCTT 277.8 0.2778 3T3 fibroblasts AACTTCCTGT AGAGCGAAGT (3) AGTGAACAAT (2) ATGGCTACGG CCAAAGCCAG GCCTTTATGA GCTGCTGCAG (3) GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) 1030.3 1.0303 E15 cortex AACTTCCTGT AGAGCGAAGT (3) GCCTTTATGA GCGGCGGTTC (2) GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TGTCCTTCTT 301.7 0.3017 P1 cortex AACTTCCTGT AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG CCTTTATGAG GCCTTTATGA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) 299.9 0.2999 Hypothalamus AAGTGAGAGG AGAGCGAAGT (3) GCCTTTATGA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TATGGCCTTT (2) TCTTGCCAGT TGGTAATCAG TGTCCTTCTT TTGGTGCTGG (3) 86.9 0.0869 E12.5 retina ACTAGTGCTT (4) AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG CAAGAACAGA (3) CAGAAGAAGT CCTTTATGAG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TATGGCCTTT (2) TGGTAATCAG 394.3 0.3943 E14.5 retina AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG CCAAAGCCAG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GCTGCTGCAG (3) GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TCTTGCCAGT TCTTGGGGTC TGTCCTTCTT TTGGTGCTGG (3) 183.9 0.1839 E16.5 retina AACTTCCTGT AGAGCGAAGT (3) AGTGAACAAT (2) AGTTACTTTT (3) CAAGAACAGA (3) CCAAAGCCAG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GCGGCGGTTC (2) GGCAAAGTGT (5) GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TCTTGGGGTC TGTCCTTCTT TTGGTGCTGG (3) 164.6 0.1646 E18.5 retina AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGCAAAGTGT (5) GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TCTTGCCAGT TGGTAATCAG TGTCCTTCTT 221.8 0.2218 P0.5 retina ACCAACCGTC (2) AGAGCGAAGT (3) AGTTACTTTT (3) ATGGCTACGG CCAAAGCCAG CCTTTATGAG GCCTTTATGA GCGAAGGCCA GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TACTTCAGAT TGTCCTTCTT 322 0.322 P2.5 retina AGAGCGAAGT (3) AGTTACTTTT (3) ATGGCTACGG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GCGAAGGCCA GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TTGGTGCTGG (3) 179.7 0.1797 P4.5 retina AACTTCCTGT ACTAGTGCTT (4) AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG CAAGAACAGA (3) GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TGGTAATCAG TTGGTGCTGG (3) 230 0.23 P6.5 retina AGAGCGAAGT (3) ATGGCTACGG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TACTTCAGAT TGGTAATCAG TTGGTGCTGG (3) 185.2 0.1852 P10.5 crx- retina AACTTCCTGT AAGTGAGAGG ACCAACCGTC (2) AGAGCGAAGT (3) AGTTACTTTT (3) CCAAAGCCAG GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TACTTCAGAT TATGGCCTTT (2) 256.5 0.2565 P10.5 crx+ retina AAGTGAGAGG AGAGCGAAGT (3) AGTTACTTTT (3) ATGGCTACGG CAGAAGAAGT GCCTTTACGA GCCTTTATGA GGGAAGCCAG TAAAAAAAAA (3) TACTTCAGAT TATGGCCTTT (2) 174.8 0.1748 Adult retinal AACTTCCTGT AGAGCGAAGT (3) ATGAACACTG (9) GCCTTTACGA GCCTTTATGA GCGAAGGCCA GCTGCTGCAG (3) GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TATGGCCTTT (2) 144.7 0.1447 ONL AGAGCGAAGT (3) AGTTACTTTT (3) ATGAACACTG (9) GCCTTTATGA GCTGCTGCAG (3) GGGAAGCCAG GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TATGGCCTTT (2) TCTTGCCAGT TTGGTGCTGG (3) 189.5 0.1895