Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.1843 Hspcaheat shock protein 1, alpha 12  12 F1 (12 48.0 cM)  15519 
 Mm.1843 4932703K07RikRIKEN cDNA 4932703K07 gene 12    71006 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 9 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 136 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCACACAGAT (4)
CTAACAGGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
65.30.0653
Cb medulloblastomaAAGGCTTTGG (4)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
CGTGATGTGT (2)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
43.80.0438
P8 GC+1d cultureAAAACTAAGG (2)
CCACACAGAT (4)
CGTGATGTGT (2)
GCAGCAAAGA (3)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
50.20.0502
P8 GC+SHH+1d cultureCCACACAGAT (4)
CTTTCGGAGA (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TACTAGTCTT (2)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
45.70.0457
3T3 fibroblastsAAGGCTTTGG (4)
GAGGCTTTGC (4)
GAGGCTTTGG (10)
GCTTAGAAGT (4)
87.60.0876
E15 cortexGAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCTTAGAAGT (4)
108.70.1087
P1 cortexCCACACAGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
59.10.0591
HypothalamusAAGGCTTTGG (4)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
CTTTCGGAGA (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GAGGCTTTGG (10)
TATTAGTCTT (4)
47.10.0471
E12.5 retinaAAAACTAAGG (2)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GAGGCTTTGG (10)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
58.40.0584
E14.5 retinaAAAACTAAGG (2)
AAGGCTTTGG (4)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
CGTGATGTGT (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GCAGCAAAGA (3)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
47.10.0471
E16.5 retinaAAAACTAAGG (2)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCAGCAAAGA (3)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
34.30.0343
E18.5 retinaAAAACTAAGG (2)
AAGGCTTTGG (4)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TACTAGTCTT (2)
TATTAGTCTT (4)
45.30.0453
P0.5 retinaAAAACTAAGG (2)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
TATTAGTCTT (4)
TGAAGGAACG (2)
23.60.0236
P2.5 retinaAAGGCTTTGG (4)
CCACACAGAT (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
31.70.0317
P4.5 retinaCCACACAGAT (4)
GAAAATATAT (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
27.80.0278
P6.5 retinaAAGGCTTTGG (4)
CCACACAGAT (4)
CGTGATGTGT (2)
GCAGCAAAGA (3)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TGAAGGAACG (2)
TTTGCTCTGG (3)
40.10.0401
P10.5 crx- retinaAAAACTAAGG (2)
AAGGCTTTGG (4)
CCACACAGAT (4)
CGTGATGTGT (2)
CTAACAGGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCAGCAAAGA (3)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
93.20.0932
P10.5 crx+ retinaCAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
CGTGATGTGT (2)
CTTTCGGAGA (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGG (10)
TATTAGTCTT (4)
63.30.0633
Adult retinalCAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
CGTGATGTGT (2)
GAAAATATAT (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
48.40.0484
ONLCCACACAGAT (4)
TATTAGTCTT (4)
76.60.0766