Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.1963 Srrm1serine/arginine repetitive matrix 1 4    51796 
 Gene Ontology nuclear matrix | nuclear mRNA splicing, via spliceosome | pre-mRNA splicing factor activity | protein binding | RNA binding | spliceosome complex
 Human Homolog SRRM1[serine/arginine repetitive matrix 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
34.20.0342
Cb medulloblastomaCCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
GAGGGCCAGA (2)
GTGAACTTCA
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
120.10.1201
P8 GC+1d cultureACGGGAGCCA (2)
CCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
TTTCTCCTTA
TTTGTTATGT
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
66.20.0662
P8 GC+SHH+1d cultureACGGGAGCCA (2)
CCAAAAAAAA (3)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
66.80.0668
3T3 fibroblastsACGGGAGCCA (2)
GGAGAGCTGT (2)
GTGAACTTCA
210.021
E15 cortexCCAAAAAAAA (3)
GAGGGCCAGA (2)
GGAGAGCTGT (2)
TTTTTTTTTT (2)
24.60.0246
P1 cortexCCAAAAAAAA (3)
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
49.90.0499
HypothalamusCCAAAAAAAA (3)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
63.30.0633
E12.5 retinaACGGGAGCCA (2)
CCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
37.60.0376
E14.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
GTGAACTTCA
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
58.20.0582
E16.5 retinaACGGGAGCCA (2)
ATTACGCCAA
CCAAAAAAAA (3)
GAGGGCCAGA (2)
GGAGAGCTGT (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTTTTTTT (2)
34.30.0343
E18.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
GGAGAGCTGT (2)
GTGAACTTCA
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
76.30.0763
P0.5 retinaACGGGAGCCA (2)
ATTACGCCAA
CCAAAAAAAA (3)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTGTTATGT
TTTTTTTTTT (2)
570.057
P2.5 retinaACGGGAGCCA (2)
CCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
810.081
P4.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
67.30.0673
P6.5 retinaCCAAAAAAAA (3)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
61.60.0616
P10.5 crx- retinaCCAAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTTAAAAAA (2)
18.70.0187
P10.5 crx+ retinaACGGGAGCCA (2)
CCAAAAAAAA (3)
GTGAACTTCA
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
49.80.0498
Adult retinalACGGGAGCCA (2)
ATTACGCCAA
CCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
TTTCTCCTTA
TTTTTTTTTT (2)
57.50.0575
ONLACGGGAGCCA (2)
CCAAAAAAAA (3)
GACCGCAGGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTCTCCTTA
TTTGTTATGT
TTTTAAAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
38.30.0383