Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.213408 D16Ium21eDNA segment, Chr 16, Indiana University Medical 21, expressed 16  16 67.4 cM  28186 
 Mm.213408 Ttc3tetratricopeptide repeat domain 3 16  16 67.9 cM  22129 
 Mm.213408 2610202A04RikRIKEN cDNA 2610202A04 gene 16    70444 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 193 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGCTAAAG (3)
AAGATGAGGG (4)
AAGCAGTGGA
ACTTCCTGTG
CAATCTTGTA (3)
CCTGTGCCAC
CCTTACACTT (4)
CTGGAGTGAC
CTTAAAAAAA (2)
GCCCCTGCGC (3)
GCTCTGAACA
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TCGGAGAAGA
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
81.40.0814
Cb medulloblastomaAAAGCTAAAG (3)
AGACTTCAAA
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
TAAAAAGAAA
TCGGAGAAGA
TGAACCTTGA (3)
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
85.40.0854
P8 GC+1d cultureACTTCCTGTG
AGACTTCAAA
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GAGCTTGATT
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TAAAAAGAAA
TCGGAGAAGA
TGGCACTGTA (3)
TTGAGAACTG
102.60.1026
P8 GC+SHH+1d cultureAAGCAGTGGA
AGACTTCAAA
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GAGCTTGATT
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TCGGAGAAGA
TGAACCTTGA (3)
TGGCACTGTA (3)
TTGAGAACTG
TTTTGAGTGA (3)
71.60.0716
3T3 fibroblastsTCGGAGAAGA
TGAGAACTGC (5)
10.50.0105
E15 cortexACTTCCTGTG
CAATCTTGTA (3)
CCTTACACTT (4)
GGGAGACTCT
TCGGAGAAGA
TGAGAACTGC (5)
TTTTGAGTGA (3)
118.60.1186
P1 cortexAAGATGAGGG (4)
CAATCTTGTA (3)
CCTTACACTT (4)
GAAGCTCTCA (4)
GCCCCTGCGC (3)
TCGGAGAAGA
TGGCACTGTA (3)
TTGAGAACTG
TTTTGAGTGA (3)
86.20.0862
HypothalamusAAAGCTAAAG (3)
AGACTTCAAA
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GAAGCTCTCA (4)
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TAAAAAGAAA
TGGCACTGTA (3)
TTGAGAACTG
TTTTGAGTGA (3)
90.60.0906
E12.5 retinaAAAGCTAAAG (3)
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GCCCCTGCGC (3)
GCTCTGAACA
GTAACCTTAG
TCGGAGAAGA
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
39.60.0396
E14.5 retinaCCTGTGCCAC
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GATGACTTTG (5)
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
TCGGAGAAGA
TGGCACTGTA (3)
45.40.0454
E16.5 retinaAAAGCTAAAG (3)
AAGATGAGGG (4)
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GCCCCTGCGC (3)
GTAACCTTAG
TAAAAAGAAA
TCGGAGAAGA
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
46.90.0469
E18.5 retinaCCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GAAGCTCTCA (4)
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TCGGAGAAGA
TGGCACTGTA (3)
41.80.0418
P0.5 retinaCCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GATGACTTTG (5)
GCCCCTGCGC (3)
GTAACCTTAG
TAAAAAGAAA
TCGGAGAAGA
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
47.30.0473
P2.5 retinaAAAGCTAAAG (3)
AAGATGAGGG (4)
CACTACACTG (4)
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TCGGAGAAGA
TGAACCTTGA (3)
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
TTGAGAACTG
74.30.0743
P4.5 retinaCCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GATGAGTTTG (3)
GCCCCTGCGC (3)
GTAACCTTAG
TAAAAAGAAA
TCGGAGAAGA
TGAGAACTGC (5)
43.60.0436
P6.5 retinaCACTACACTG (4)
CCTTACACTT (4)
CTGGAGTGAC
CTTAAAAAAA (2)
GATGACTTTG (5)
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TAAAAAGAAA
TCGGAGAAGA
TGAGAACTGC (5)
TTTTGAGTGA (3)
63.40.0634
P10.5 crx- retinaAGACTTCAAA
CCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GCCCCTGCGC (3)
TAAAAAGAAA
TCGGAGAAGA
TGAACCTTGA (3)
TTTTGAGTGA (3)
42.90.0429
P10.5 crx+ retinaCCTTACACTT (4)
CTTAAAAAAA (2)
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
GTAACCTTAG
TCGGAGAAGA
TGGCACTGTA (3)
TTGAGAACTG
TTTTGAGTGA (3)
53.80.0538
Adult retinalAAGATGAGGG (4)
CACTACACTG (4)
CCTTACACTT (4)
CTGGAGTGAC
CTTAAAAAAA (2)
GAGCTTGATT
GCCCCTGCGC (3)
GGGAGACTCT
TAAAAAGAAA
TGAACCTTGA (3)
TGAGAACTGC (5)
TTGAGAACTG
50.40.0504
ONLACTTCCTGTG
CCTTACACTT (4)
GATGACTTTG (5)
GCCCCTGCGC (3)
GTAACCTTAG
TAAAAAGAAA
190.019