Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.215034 RNU19RNA, U19 small nucleolar 18    436583 
 Mm.215034 1110061A14RikRIKEN cDNA 1110061A14 gene 18    68827 
 Mm.215034 AY223547cDNA sequence AY223547     448986 
 Mm.215034 Matr3matrin 3 18  18 15.0 cM  17184 
 Mm.215034 2810017I02RikRIKEN cDNA 2810017I02 gene 18    69967 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 132 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATGAAGTTC (5)
AATTAGAAGC (5)
ACATTAAAAG (5)
AGGTCACCCT (5)
CAAAAAGGCA (5)
TATAATCTGT (5)
TGACCTTTGT (6)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
50.50.0505
Cb medulloblastomaAATGAAGTTC (5)
CAAAAAGGCA (5)
CAGGATTCCT (5)
CTTTAACAAA (5)
GAAGTCGTTC (6)
GTGGCATATA (5)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
41.40.0414
P8 GC+1d cultureAATGAAGTTC (5)
CAGGATTCCT (5)
CTGTTTAGAT (5)
CTTTAACAAA (5)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
31.70.0317
P8 GC+SHH+1d cultureAATGAAGTTC (5)
AATTAGAAGC (5)
AGGTCACCCT (5)
CTGTTTAGAT (5)
CTTTAACAAA (5)
GAAGTCGTTC (6)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
50.40.0504
3T3 fibroblastsAATTAGAAGC (5)
3.50.0035
E15 cortexCTTCTTGAAT (7)
GTGGCATATA (5)
TATAATCTGT (5)
14.70.0147
P1 cortexACATTAAAAG (5)
CAGGATTCCT (5)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTTGGATGTT (5)
68.10.0681
HypothalamusCAGGATTCCT (5)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTTGGATGTT (5)
30.90.0309
E12.5 retinaCTTCTTGAAT (7)
TATAATCTGT (5)
TTGAAAAAAA (9)
15.10.0151
E14.5 retinaAATTAGAAGC (5)
CTGTTTAGAT (5)
GAAGTCGTTC (6)
TATAATCTGT (5)
TTTGGATGTT (5)
23.60.0236
E16.5 retinaCTTCTTGAAT (7)
CTTTAACAAA (5)
GTGGCATATA (5)
TATAATCTGT (5)
TGACCTTTGT (6)
TGGCCGGCTA (5)
TTTGGATGTT (5)
25.30.0253
E18.5 retinaACATTAAAAG (5)
CTGTTTAGAT (5)
TATAATCTGT (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
36.40.0364
P0.5 retinaCACAAAAAAT (6)
CAGGATTCCT (5)
TATAATCTGT (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
33.40.0334
P2.5 retinaAATGAAGTTC (5)
AATTAGAAGC (5)
AGGTCACCCT (5)
CACAAAAAAT (6)
CTGTTTAGAT (5)
CTTCTTGAAT (7)
GTGGCATATA (5)
TATAATCTGT (5)
TTTGGATGTT (5)
35.40.0354
P4.5 retinaAGGTCACCCT (5)
CAGGATTCCT (5)
TATAATCTGT (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
41.60.0416
P6.5 retinaACATTAAAAG (5)
AGGTCACCCT (5)
CTGTTTAGAT (5)
CTTTAACAAA (5)
GTGGCATATA (5)
TATAATCTGT (5)
TGACCTTTGT (6)
TTTGGATGTT (5)
36.70.0367
P10.5 crx- retinaAATGAAGTTC (5)
AGGTCACCCT (5)
CAAAAAGGCA (5)
CACAAAAAAT (6)
CTGTTTAGAT (5)
GTGGCATATA (5)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
42.90.0429
P10.5 crx+ retinaAATGAAGTTC (5)
AATTAGAAGC (5)
CAAAAAGGCA (5)
CTGTTTAGAT (5)
CTTTAACAAA (5)
GTGGCATATA (5)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTTGGATGTT (5)
57.60.0576
Adult retinalAATGAAGTTC (5)
AATTAGAAGC (5)
CAAAAAGGCA (5)
CAGGATTCCT (5)
TATAATCTGT (5)
TGGCCGGCTA (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
24.40.0244
ONLAATGAAGTTC (5)
AGGTCACCCT (5)
CACAAAAAAT (6)
CAGGATTCCT (5)
CTTTAACAAA (5)
TATAATCTGT (5)
TTGAAAAAAA (9)
TTTGGATGTT (5)
26.70.0267