Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.21740	Hnrph1	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1	11		59013
Mm.21740	AI642080	expressed sequence AI642080	11		103805
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 183 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACTTAAAAA (3) AGCGGATATG (2) CAGCGGCCAG (2) CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTGTACATTT GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAAAT TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) TTTTTGTAAA (2) 52.2 0.0522 Cb medulloblastoma AACTTAAAAA (3) CGGGGATTAC (2) GAACACTGTG TTTGTTAATT (3) 78.6 0.0786 P8 GC+1d culture AACTTAAAAA (3) CGGGGATTAC (2) CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) GAACACTGTG TGTACACAGT (2) TTAGTTAGTT TTTGTTAAAT TTTGTTAATC (3) TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) TTTTTGTAAA (2) 86.6 0.0866 P8 GC+SHH+1d culture AACTTAAAAA (3) CAGCGGCCAG (2) CGGGGATTAC (2) CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) GAACACTGTG TGTACACAGT (2) TTTGTTAATC (3) TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) 56.5 0.0565 3T3 fibroblasts GAACACTGTG GGCTTGTGTA (3) 7 0.007 E15 cortex CTGTACATTT TTTGTTAATT (3) 9.8 0.0098 P1 cortex AAACTGACTA (2) AACTTAAAAA (3) CTGTACATTT TGTACACAGT (2) TTAGTTAGTT TTTGTTAATT (3) TTTTTGTAAA (2) 99.9 0.0999 Hypothalamus AACTTAAAAA (3) CAGCTCCCAA CGGGGATTAC (2) TTAGTTAGTT TTTGTTAAAT TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) TTTTTGTAAA (2) 38 0.038 E12.5 retina AAACTGACTA (2) CAGCGGCCAG (2) CGGGGATTAC (2) GAACACTGTG GGCTTGTGTA (3) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) TTTTTGTAAA (2) 52.7 0.0527 E14.5 retina AACTTAAAAA (3) CAGCGGCCAG (2) CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTGCTCTGGC CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) TTAGTTAGTT TTTGGCAGCA (2) TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) TTTTTGTAAA (2) 72.7 0.0727 E16.5 retina AACTTAAAAA (3) AGCGGATATG (2) CAGCGGCCAG (2) CAGCTCCCAA CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTGCTCTGGC CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) GGCTTGTGTA (3) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) TTTTTGTAAA (2) 59.6 0.0596 E18.5 retina AACTTAAAAA (3) AAGATGTGTT CAGCTCCCAA CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) GGCTTGTGTA (3) TTTGGCAGCA (2) TTTGTTAATC (3) TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) TTTTTGTAAA (2) 50.8 0.0508 P0.5 retina AAACTGACTA (2) AACTTAAAAA (3) CAGCTCCCAA CATCAACAGT (2) CTGCTCTGGC CTGGGATGGC (3) CTGTACATTT GGCTTGTGTA (3) TTAGTTAGTT TTTGTTAAAT TTTGTTAATT (3) TTTTTGTAAA (2) 53.1 0.0531 P2.5 retina AACTTAAAAA (3) AAGATGTGTT AGCGGATATG (2) CAGCTCCCAA CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTGGGATGGC (3) CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) GAACACTGTG GGCTTGTGTA (3) GGTTTGTGTA (2) TTTGTTAATT (3) TTTTTCAAAA (2) TTTTTGTAAA (2) 79.5 0.0795 P4.5 retina AAACTGACTA (2) AACTTAAAAA (3) CAGCGGCCAG (2) CAGCTCCCAA CTGGGATGGC (3) CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) GGCTTGTGTA (3) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) TTTTTGTAAA (2) 69.5 0.0695 P6.5 retina AACTTAAAAA (3) AGCGGATATG (2) CAGCTCCCAA CGGGGATTAC (2) CTGGGATGGC (3) CTGTACATTT GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAATT (3) 58.5 0.0585 P10.5 crx- retina AACTTAAAAA (3) CAGCTCCCAA CATCAACAGT (2) CTGCTCTGGC CTGTACATTT GAACACTGTG GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAATT (3) TTTTTGTAAA (2) 78.1 0.0781 P10.5 crx+ retina AACTTAAAAA (3) CAGCGGCCAG (2) CAGCTCCCAA CGGGGATTAC (2) CTGTACATTT TGTACACAGT (2) TTTGTTAAAT TTTGTTAATT (3) TTTTTGTAAA (2) 67.1 0.0671 Adult retinal AACTTAAAAA (3) AGCGGATATG (2) CAGCTCCCAA CTGTACATTT GAACACTGTG TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) 48.4 0.0484 ONL AAGATGTGTT CAGCTCCCAA CGGGGATTAC (2) CTGTACATTT CTTTTTTGTA (2) GGTTTGTGTA (2) TTTGGCAGCA (2) TTTGTTAATT (3) TTTTTGTAAA (2) 45.8 0.0458