Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.218473	Tde1	tumor differentially expressed 1	2		26943
Mm.218473	0610039K10Rik	RIKEN cDNA 0610039K10 gene	2		68386
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 84 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) GTGACGCCGG (2) TCAGTTTATT (2) 27.7 0.0277 Cb medulloblastoma AACTACAGCT (2) ACCAATGAAC (2) ATCAATGAAC (2) CCTTTGACTT (2) GTGACGCCGG (2) TCAGTTTATT (2) TGTCAAAGCA (2) 476.2 0.4762 P8 GC+1d culture AACTACAGCT (2) ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) CCTTTGACTT (2) TCAGTTTATT (2) TGTCAAAGCA (2) 57.1 0.0571 P8 GC+SHH+1d culture AACTACAGCT (2) ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) TCAGTTTATT (2) TGTCAAAGCA (2) TTAAAAAACA (2) TTAAAACAAA (3) 39.9 0.0399 3T3 fibroblasts AACTACAGCT (2) 7 0.007 E15 cortex AGAAGGAGGG (2) ATGACAGAAG (2) 9.8 0.0098 P1 cortex AACTACAGCT (2) ACCAATGAAC (2) AGAAGGAGGG (2) ATGACAGAAG (2) TCAGTTTATT (2) 27.1 0.0271 Hypothalamus ACCAATGAAC (2) TCAGTTTATT (2) 851.2 0.8512 E12.5 retina ACCAATGAAC (2) ATGTACAAGG (2) TCAGTTTATT (2) 18.8 0.0188 E14.5 retina AACTACAGCT (2) ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) TCAGTTTATT (2) TTAAAAAACA (2) TTAAAACAAA (3) 38.1 0.0381 E16.5 retina ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) GTGACGCCGG (2) TCAGTTTATT (2) TGTCAAAGCA (2) TTAAAAAACA (2) 25.3 0.0253 E18.5 retina ACCAATGAAC (2) GTGACGCCGG (2) TCAGTTTATT (2) TGTCAAAGCA (2) 18.1 0.0181 P0.5 retina ATGACAGAAG (2) ATGTACAAGG (2) GGCAGCCCCT (2) TCAGTTTATT (2) TTAAAACAAA (3) 15.8 0.0158 P2.5 retina ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) TCAGTTTATT (2) 28.2 0.0282 P4.5 retina ACCAATGAAC (2) TCAGTTTATT (2) TTAAAACAAA (3) 35.7 0.0357 P6.5 retina ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) ATGTACAAGG (2) TCAGTTTATT (2) TGTCAAAGCA (2) 46.7 0.0467 P10.5 crx- retina ATGACAGAAG (2) TCAGTTTATT (2) 35.3 0.0353 P10.5 crx+ retina ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) TCAGTTTATT (2) TGTCAAAGCA (2) TTAAAAAACA (2) 23 0.023 Adult retinal ACCAATGAAC (2) TCAGTTTATT (2) 51.9 0.0519 ONL AACTACAGCT (2) ACCAATGAAC (2) ATGACAGAAG (2) CCTTTGACTT (2) TCAGTTTATT (2) TTAAAACAAA (3) 36.4 0.0364