Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.22130 2610007O09RikRIKEN cDNA 2610007O09 gene 2    66579 
 Mm.22130 Rpn2ribophorin II 2  2 91.0 cM  20014 
 Mm.22130 Rpn2-rs1ribophorin 2, related sequence 1 7  7 66.0 cM  20015 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 140 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGTTACATC (5)
CTGGGCCAGA
CTTGGGCCCA (3)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GCTTGTGGAT (2)
TTTGGGCCCA (4)
310.031
Cb medulloblastomaCAGTTACATC (5)
GAAGACCCAA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GATCACAGCA
GCTTGTGGAT (2)
GTGTGAAAGG (4)
TAAGCACAGC (3)
TGTGTGCGAG
TTTGGGCCCA (4)
39.10.0391
P8 GC+1d cultureAAAGAACAGT (3)
CAGTTACATC (5)
CTGGGCCAGA
GAGAGACTGT
TAAGCACAGC (3)
TAAGCACAGG (5)
TGTGTGCGAG
TTTGGGCCCA (4)
31.70.0317
P8 GC+SHH+1d cultureCAGTTACATC (5)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GGGTACAGGT
TTTGGGCCCA (4)
270.027
3T3 fibroblastsCAGTTACATC (5)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GTGTGAAAGG (4)
TTGGGCCCAG (4)
TTTGGGCCCA (4)
560.056
E15 cortexCTGGGCCAGA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GTGTGAAAGG (4)
TTTGGGCCCA (4)
44.40.0444
P1 cortexGAGAGACTGT
GTGTGAAAGG (4)
TAAGCACAGG (5)
TTTGGGCCCA (4)
180.018
HypothalamusAAAAGTGTCA
CAACACCAAT (3)
CAGTTACATC (5)
CTGGGCCAGA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
TGTGTGCGAG
TTTGGGCCCA (4)
34.20.0342
E12.5 retinaCAGTTACATC (5)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
TAAGCACAGC (3)
TTTGGGCCCA (4)
33.80.0338
E14.5 retinaATTTTGGAAT (4)
CAGTTACATC (5)
GAAACACAAA (2)
GAAGACCCAA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GGGTACAGGT
TAAGCACAGC (3)
TTTGGGCCCA (4)
290.029
E16.5 retinaATTTTGGAAT (4)
CAGTTACATC (5)
GAGAGACTGT
TAAGCACAGC (3)
TAAGCACAGG (5)
TTTGGGCCCA (4)
41.70.0417
E18.5 retinaAAAGAACAGT (3)
CAGTTACATC (5)
CTGGGCCAGA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GCTTGTGGAT (2)
GTGTGAAAGG (4)
TAAGCACAGC (3)
TTTGGGCCCA (4)
36.40.0364
P0.5 retinaCAGTTACATC (5)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
TAAGCACAGG (5)
TTTGGGCCCA (4)
35.30.0353
P2.5 retinaCAGTTACATC (5)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
TAAGCACAGG (5)
TTTGGGCCCA (4)
300.03
P4.5 retinaCAGTTACATC (5)
CTTGGGCCCA (3)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
TTTGGGCCCA (4)
29.80.0298
P6.5 retinaCAACACCAAT (3)
CAGTTACATC (5)
CTGGGCCAGA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GATCACAGCA
GTGTGAAAGG (4)
TGTGTGCGAG
TTTGGGCCCA (4)
38.40.0384
P10.5 crx- retinaATTTTGGAAT (4)
CAGTTACATC (5)
CTGGGCCAGA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
TGTGTGCGAG
TTTGGGCCCA (4)
50.30.0503
P10.5 crx+ retinaATTTTGGAAT (4)
CAGTTACATC (5)
GAAGACCCAA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GTGTGAAAGG (4)
TAAGCACAGG (5)
TTTGGGCCCA (4)
44.20.0442
Adult retinalAAAGAACAGT (3)
CAGTTACATC (5)
CTTGGGCCCA (3)
GAAGACCCAA
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
GGGTACAGGT
TAAGCACAGG (5)
TGTGTGCGAG
TTGGGCCCAG (4)
TTTGGGCCCA (4)
52.20.0522
ONLAAAAGTGTCA
CAACACCAAT (3)
CTGGGCCAGA
GAAACACAAA (2)
GACCACGTGG
GAGAGACTGT
TAAGCACAGG (5)
TTTGGGCCCA (4)
34.30.0343