Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.223674 Sypsynaptophysin X  X 1.5 cM  20977 
 Mm.223674 A230093K24RikRIKEN cDNA A230093K24 gene X    319279 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 62 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGGGGCCCTGG (3)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
4.80.0048
Cb medulloblastomaCACTAGGGGC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GGGGCCCTGG (3)
GTTGGGAGCT (2)
TCGATATCAA (2)
300.03
P8 GC+1d cultureCACTAGGGGC (2)
CGCGCACCTC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
34.10.0341
P8 GC+SHH+1d cultureCGCGCACCTC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
15.30.0153
E15 cortexCACTAGGGGC (2)
GTTGGGAGCT (2)
19.70.0197
P1 cortexGTTGGGAGCT (2)
22.70.0227
HypothalamusCACTAGGGGC (2)
CGCGCACCTC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GGGGCCCTGG (3)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
TCGATATCAA (2)
43.40.0434
E14.5 retinaGAGTGGGTCG (2)
GGGGCCCTGG (3)
GTTGGGAGCT (2)
TCGATATCAA (2)
7.20.0072
E16.5 retinaGTTGGGAGCT (2)
1.80.0018
P0.5 retinaCACTAGGGGC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
9.80.0098
P2.5 retinaGTTGGGAGCT (2)
1.80.0018
P4.5 retinaCACTAGGGGC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GGGGCCCTGG (3)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
160.016
P6.5 retinaCGCGCACCTC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
21.80.0218
P10.5 crx- retinaGTTGGGAGCT (2)
130.013
P10.5 crx+ retinaCACTAGGGGC (2)
CGCGCACCTC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GGGGCCCTGG (3)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
250.025
Adult retinalCACTAGGGGC (2)
CGCGCACCTC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GGGGCCCTGG (3)
GTGGGTTCCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
44.60.0446
ONLCACTAGGGGC (2)
CGCGCACCTC (2)
GAGTGGGTCG (2)
GTTGGGAGCT (2)
17.20.0172