Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.227260	4930542G03Rik	RIKEN cDNA 4930542G03 gene	2		227613
Gene Ontology	GTP binding
Human Homolog	TUBB2[tubulin, beta, 2]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 83 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACACCTTCA (2) ATGGCTCCTT GCTGTGAACT TCCACTGTGC 73.5 0.0735 Cb medulloblastoma GCCTTGGGTT (2) GCTGTGAACT GGAGCAGTGT TCCACTGTGC 41.5 0.0415 P8 GC+1d culture AACGACCTGG ATGGCTCCTT GAACACCTTT GAGTGGGGGT GCTGTGAACT TCCACTGTGC 39.9 0.0399 P8 GC+SHH+1d culture AAGGTGGGGG (3) ATGGCTCCTT GCTGTGAACT TCCACTGTGC 55 0.055 3T3 fibroblasts GCCTTGGGTT (2) GCTGTGAACT TCCACTGTGC 73.6 0.0736 E15 cortex GCCTTGGGTT (2) TCCACTGTGC 14.8 0.0148 P1 cortex GAGTGGGGGT TCCACTGTGC 31.8 0.0318 Hypothalamus AATGGGTGGC (3) ATGGCTCCTT GAGTGGGGGT GCCTTGGGTT (2) TCCACTGTGC 41.6 0.0416 E12.5 retina AACACCTTCA (2) CCTGGCTTTG (3) GAACACCTTT GAGTGGGGGT GCTGTGAACT TCCACTGTGC 58.3 0.0583 E14.5 retina ATGGCTCCTT CCTGGCTTTG (3) GAGTGGGGGT GCTGTGAACT TCCACTGTGC TCCCCTGTGC (3) 50.9 0.0509 E16.5 retina AACACCTTCA (2) AATGGGTGGC (3) CCTGGCTTTG (3) GAGTGGGGGT GCTGTGAACT TCATTTGGCC (2) TCCACTGTGC 115.8 0.1158 E18.5 retina AACGACCTGG ATGGCTCCTT CCTGGCTTTG (3) GAGTGGGGGT GCCTTGGGTT (2) TCCACTGTGC 67.2 0.0672 P0.5 retina AATGGGTGGC (3) GAACACCTTT GAGTGGGGGT GCCTTGGGTT (2) GGAGCAGTGT TCCACTGTGC 72.7 0.0727 P2.5 retina AAGGTGGGGG (3) GAGTGGGGGT TCCACTGTGC 63.4 0.0634 P4.5 retina TCATTTGGCC (2) TCCACTGTGC 29.8 0.0298 P6.5 retina ATGGCTCCTT GGAGCAGTGT TCCACTGTGC 26.7 0.0267 P10.5 crx- retina ATGGCTCCTT GGAGCAGTGT TCCACTGTGC 61.4 0.0614 P10.5 crx+ retina AACACCTTCA (2) GAGTGGGGGT GCCTTGGGTT (2) TCCACTGTGC 44.1 0.0441 Adult retinal AACACCTTCA (2) AATGGGTGGC (3) ATGGCTCCTT GCCTTGGGTT (2) TCCACTGTGC 22.3 0.0223 ONL AAGGTGGGGG (3) TCCACTGTGC 9.6 0.0096