Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.240490	1200009K13Rik	RIKEN cDNA 1200009K13 gene	6		66870
Mm.240490	9330147J08Rik	RIKEN cDNA 9330147J08 gene	6		320467
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 273 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAGAATGCAT (2) AATACTTTTG (3) AGCCTCTTCA (2) AGGACCACCC (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CTCATTTCCT (2) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) GGTAAGTGTG TAAACTTCTG (2) TAAGCCACCA (2) TATGAGACCT (2) TGTGAAAATG (2) TTACAATACA (2) TTCAGATCCC (3) TTCTGGAATA 128.8 0.1288 Cb medulloblastoma AATACTTTTG (3) AGTGCTGGGA (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTTAAGGATC (3) GGTGTGTTGT TAAACTTCTG (2) TAAGCCACCA (2) TGTCCAGGAC (3) TTCTGGAATA 127 0.127 P8 GC+1d culture AAAAGGTTTC (2) AAAATAAATT (3) AAGAATGCAT (2) AATACTTTTG (3) AGGACCACCC (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG GGTGTGTTGT TAAACTTCTG (2) TATGAGACCT (2) TGTCCAGGAC (3) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 103.5 0.1035 P8 GC+SHH+1d culture AAAATAAATT (3) AATACTTTTG (3) AGCGACAAAC (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG GGTGTGTTGT TAAACTTCTG (2) TAAGCCACCA (2) TATGAGACCT (2) TGTCCAGGAC (3) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 139.4 0.1394 3T3 fibroblasts AGCCTCTTCA (2) CCTGGGCACC (3) CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG 66.5 0.0665 E15 cortex CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) GAAATGGAAA GGTAAGTGTG 54.2 0.0542 P1 cortex AAAAGGTTTC (2) AATACTTTTG (3) CCAAAAAAAA (3) CTCATTTCCT (2) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) TTCTGGAATA 90.8 0.0908 Hypothalamus AAAATAAATT (3) AATACTTTTG (3) AGGACCACCC (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) CTTTGTAATC (2) GCCGCGGCCC GGTGTGTTGT TGCTAGGAAT (2) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 84.9 0.0849 E12.5 retina AAGAATGCAT (2) AATACTTTTG (3) AGCGACAAAC (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTGGAAGATT CTTAAGGATC (3) CTTTGTAATC (2) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG TAAACTTCTG (2) TAAGCCACCA (2) TTAACTAAAG (2) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 174.8 0.1748 E14.5 retina AAGAATGCAT (2) AATACTTTTG (3) AGCCTCTTCA (2) AGCGACAAAC (2) AGTGCTGGGA (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG TAAACTTCTG (2) TAAGCCACCA (2) TATGAGACCT (2) TTAACTAAAG (2) TTCTGGAATA 141.7 0.1417 E16.5 retina AAAATAAATT (3) AATACTTTTG (3) AGCCTCTTCA (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG GGTGTGTTGT TAAACTTCTG (2) TAAGCCACCA (2) TTCTGGAATA 157.5 0.1575 E18.5 retina AATACTTTTG (3) AGCCTCTTCA (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTGGAAGATT CTTAAGGATC (3) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG GGTGTGTTGT TAAGCCACCA (2) TGTCCAGGAC (3) TTCTGGAATA 159.8 0.1598 P0.5 retina AAAATAAATT (3) AAGACAAACG (2) AATACTTTTG (3) AGCGACAAAC (2) AGGACCACCC (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTTAAGGATC (3) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG TAAGCCACCA (2) TATGAGACCT (2) TTCAGATCCC (3) TTCTGGAATA 114.1 0.1141 P2.5 retina AATACTTTTG (3) AGCCTCTTCA (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG GGTGTGTTGT TGTCCAGGAC (3) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 126.7 0.1267 P4.5 retina AAGAATGCAT (2) AATACTTTTG (3) AGGACCACCC (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG TGTGAAAATG (2) TTCTGGAATA 107 0.107 P6.5 retina AAGACAAACG (2) AATACTTTTG (3) AGCCTCTTCA (2) AGGACCACCC (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) GAAATGGAAA GCCGCGGCCC GGTAAGTGTG GGTGTGTTGT TAAGCCACCA (2) TATGAGACCT (2) TGTGAAAATG (2) 93.6 0.0936 P10.5 crx- retina AAGACAAACG (2) AATACTTTTG (3) AGGACCACCC (2) CAAAAGCTTT (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTGGAAGATT CTTAAGGATC (3) CTTCAGGCCA (2) CTTTGTAATC (2) GAAATGGAAA TAAACTTCTG (2) TAAGCCACCA (2) TATGAGACCT (2) TTAACTAAAG (2) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 67.5 0.0675 P10.5 crx+ retina AAGAATGCAT (2) AAGACAAACG (2) AATACTTTTG (3) CCAAAAAAAA (3) CTTAAGGATC (3) CTTTGTAATC (2) GCCGCGGCCC GGCACCTACA GGTGTGTTGT TAAGCCACCA (2) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 80.6 0.0806 Adult retinal AAAAGGTTTC (2) AATACTTTTG (3) AGTGCTGGGA (2) CCAAAAAAAA (3) CCTGGGCACC (3) CTCATTTCCT (2) CTGAAGATTC (3) CTTAAGGATC (3) CTTTGTAATC (2) GGCACCTACA GGTGTGTTGT TTCAGATCCC (3) TTCTGGAATA 70.7 0.0707 ONL AATACTTTTG (3) CCAAAAAAAA (3) CTTAAGGATC (3) GGCACCTACA GGTAAGTGTG TGTGAAAATG (2) TTAACTAAAG (2) TTACAATACA (2) TTCTGGAATA 32.4 0.0324