Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.247473	Sdcbp	syndecan binding protein	4		53378
Mm.247473	AU015268	expressed sequence AU015268	4		100268
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 145 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) GACTGGTTCC (3) GAGACCTTCT (3) GTCTCTGCAG (2) TAAAAGTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TCGAAAAAAA TGCTTCAATT (3) TTTATTGCAG (2) 241.3 0.2413 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) CTTCAGAAAA (4) GAGACCTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TGCTTCAATT (3) TTTATTGCAG (2) 816.2 0.8162 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) GACTGGTTCC (3) GAGACCTTCT (3) GCCTACTTAA (2) TAAAAGTTGT (3) TGCTTCAATT (3) TTTGGCTTTA (4) 227 0.227 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) CCATTCATCA GACTGGTTCC (3) GAGACCTTCT (3) GCCTACTTAA (2) TAAAAGTTGT (3) TCGAAAAAAA TGCTTCAATT (3) TTTGGCTTTA (4) 311.4 0.3114 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) GCCTACTTAA (2) GCTGAAAGAG 35 0.035 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) CTTCAGAAAA (4) TAAAAGTTCT (3) TGCTTCAATT (3) 227.5 0.2275 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) AAATATATGT GAGAACCTTT (3) GCCTACTTAA (2) TAAAGTGTTT TGCTTCAATT (3) TTTATTGCAG (2) 272.4 0.2724 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) AAATATATGT GAGAACCTTT (3) GCCTACTTAA (2) GTCTCTGCAG (2) TAAAAGTTGT (3) TAAAGTGTTT TGCTTCAATT (3) 153.9 0.1539 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATATATGT GACTGGTTCC (3) TAAAAGTTGT (3) TAAAGTGTTT TGCTTCAATT (3) TTTGGCTTTA (4) 172.8 0.1728 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCATTCATCA GACTGGTTCC (3) GAGACCTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TGCTTCAATT (3) 111 0.111 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCATTCATCA GACTGGTTCC (3) GAGAACCTTT (3) GTCTCTGCAG (2) TAAAAGTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TAAAGTGTTT TCGAAAAAAA TGCTTCAATT (3) 88.8 0.0888 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) GACTGGTTCC (3) GAGAACCTTT (3) TAAAAGTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TCGAAAAAAA TGCTTCAATT (3) 414.7 0.4147 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCATTCATCA CTTCAGAAAA (4) GACTGGTTCC (3) GAGACCTTCT (3) GCCTACTTAA (2) TAAAAGTTCT (3) TAAAGTGTTT TGCTTCAATT (3) 147.5 0.1475 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) CTTCAGAAAA (4) GACTGGTTCC (3) GAGAACCTTT (3) GCCTACTTAA (2) GCTGAAAGAG TAAAAGTTGT (3) TCGAAAAAAA TGCTTCAATT (3) 375 0.375 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) GACTGGTTCC (3) GAGAACCTTT (3) GCTGAAAGAG TAAAAGTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TCGAAAAAAA TGCTTCAATT (3) 315.1 0.3151 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATATATGT GACTGGTTCC (3) GAGACCTTCT (3) TAAAAGTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TGCTTCAATT (3) TTTGGCTTTA (4) 296.8 0.2968 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) AAATATATGT CTTCAGAAAA (4) GACTGGTTCC (3) GAGAACCTTT (3) GCCTACTTAA (2) TAAAAGTTGT (3) TAAAGTGTTT 76.3 0.0763 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) AAATATATGT CTTCAGAAAA (4) GACTGGTTCC (3) GAGACCTTCT (3) TAAAAGTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TGCTTCAATT (3) 119 0.119 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) GACTGGTTCC (3) TAAAAGTTCT (3) TAAAAGTTGT (3) TGCTTCAATT (3) TTTGGCTTTA (4) 70.5 0.0705 ONL AAAAAAAAAA (2) GAGAACCTTT (3) GCCTACTTAA (2) TAAAAGTTCT (3) TGCTTCAATT (3) TTTATTGCAG (2) 122.5 0.1225