Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.257276 1110004P21RikRIKEN cDNA 1110004P21 gene 4    68478 
 Mm.257276 Sfpqsplicing factor proline/glutamine rich (polypyrimidine tract binding protein associated) 4  4 57.6 cM  71514 
 Gene Ontology biological_process unknown | cellular_component unknown | nucleic acid binding
 Human Homolog SFPQ[splicing factor proline/glutamine rich (polypyrimidine tract binding protein associated)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 135 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GAGGAACTTC (2)
GCAAATCCAA (2)
GCACATTTGA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
70.30.0703
Cb medulloblastomaGCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
16.10.0161
P8 GC+1d cultureAATAGCAAAG (2)
CACTGGAGGT (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
35.30.0353
P8 GC+SHH+1d cultureAATAGCAAAG (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TAGCCCATCC (2)
TATTAAGATT (2)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
39.80.0398
3T3 fibroblastsAATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
TTGTGTGCTG (2)
31.50.0315
E15 cortexAAAAGAGGAA (3)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GAGGAACTTC (2)
GCACATTTGA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
83.90.0839
P1 cortexAAAAGAGGAA (3)
CGTACTGAGC (2)
GCACATTTGA (2)
TTGTGTGCTG (2)
72.60.0726
HypothalamusGGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
12.60.0126
E12.5 retinaAATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GCACATTTGA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
30.10.0301
E14.5 retinaCGTACTGAGC (2)
GAGGAACTTC (2)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TAGCCCATCC (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
32.60.0326
E16.5 retinaAATAGCAAAG (2)
GCAAATCCAA (2)
GGAGATCCCT (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
39.70.0397
E18.5 retinaAATAGCAAAG (2)
CACTGGAGGT (2)
CCCATTCAAA (2)
GGAGATCCCT (2)
GGTCAGCTAA (2)
TATTAAGATT (2)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
400.04
P0.5 retinaAAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TTGTGTGCTG (2)
51.10.0511
P2.5 retinaAATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GGTCAGCTAA (2)
TATTAAGATT (2)
TTGTGTGCTG (2)
52.80.0528
P4.5 retinaAAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TAGCCCATCC (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
57.70.0577
P6.5 retinaAATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
46.80.0468
P10.5 crx- retinaAATAGCAAAG (2)
GAGGAACTTC (2)
GCAAATCCAA (2)
GGAGATCCCT (2)
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TTGTGTGCTG (2)
29.90.0299
P10.5 crx+ retinaAATAGCAAAG (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TTGTGTGCTG (2)
30.70.0307
Adult retinalAAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
27.90.0279
ONLAAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
GAGGAACTTC (2)
GGTCAGCTAA (2)
TATTAAGATT (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
190.019