Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.271814	5730405M06Rik	RIKEN cDNA 5730405M06 gene	11		320690
Mm.271814	A230020K14Rik	RIKEN cDNA A230020K14 gene	11		319274
Mm.271814	Ncor1	nuclear receptor co-repressor 1	11	11 B2	20185
Gene Ontology	DNA binding | nucleus | receptor activity | regulation of transcription, DNA-dependent
Human Homolog	NCOR1[nuclear receptor co-repressor 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 6 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 61 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AATTAAAAAT (4) CCAGCTTAAC (3) CGCCCCATCT (3) GATGAGGAAG (5) GGTATGTTAT (5) 18 0.018 Cb medulloblastoma AATTAAAAAT (4) GATGAGGAAG (5) GGTATGTTAT (5) 6.9 0.0069 P8 GC+1d culture ATGTCTTTAA (3) CGCCCCATCT (3) GGTATGTTAT (5) 4.5 0.0045 P8 GC+SHH+1d culture AATTAAAAAT (4) CCAGCTTAAC (3) CGCCCCATCT (3) GGTATGTTAT (5) 7 0.007 3T3 fibroblasts CGCCCCATCT (3) 7 0.007 E15 cortex CGCCCCATCT (3) GATGAGGAAG (5) 14.8 0.0148 P1 cortex CGCCCCATCT (3) 4.5 0.0045 Hypothalamus CGCCCCATCT (3) 1.8 0.0018 E12.5 retina ACATACTGGG (3) ATGTCTTTAA (3) CGCCCCATCT (3) GGTATGTTAT (5) 7.6 0.0076 E14.5 retina ATGTCTTTAA (3) CGCCCCATCT (3) GATGAGGAAG (5) 7.2 0.0072 E16.5 retina ACATACTGGG (3) CGCCCCATCT (3) GATGAGGAAG (5) GGTATGTTAT (5) 14.4 0.0144 E18.5 retina GATGAGGAAG (5) GGTATGTTAT (5) 3.6 0.0036 P0.5 retina CAGGTTTCAA (5) GATGAGGAAG (5) GGTATGTTAT (5) 6 0.006 P2.5 retina CAGGTTTCAA (5) CGCCCCATCT (3) GGTATGTTAT (5) 12.3 0.0123 P4.5 retina AAAAGGAGAT (4) ACATACTGGG (3) ATACGAAGTC (3) CCAGCTTAAC (3) CGCCCCATCT (3) GGTATGTTAT (5) 17.9 0.0179 P6.5 retina AAAAGGAGAT (4) CCAGCTTAAC (3) GGTATGTTAT (5) 6.7 0.0067 P10.5 crx- retina ATACGAAGTC (3) CCAGCTTAAC (3) CGCCCCATCT (3) GGTATGTTAT (5) 11.2 0.0112 P10.5 crx+ retina AAAAGGAGAT (4) ATACGAAGTC (3) CGCCCCATCT (3) GATGAGGAAG (5) 7.6 0.0076 Adult retinal ATGTCTTTAA (3) CCAGCTTAAC (3) CGCCCCATCT (3) GATGAGGAAG (5) GGTATGTTAT (5) 13.1 0.0131