Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.271986 5330414D10RikRIKEN cDNA 5330414D10 gene 2  2 H4  245867 
 Gene Ontology protein modification | protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase activity | S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity
 Human Homolog C20orf36[chromosome 20 open reading frame 36]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 5 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (3)
GAACTTTAAG (4)
55.50.0555
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (3)
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
57.80.0578
P8 GC+1d cultureCAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
TGACTCACCA
480.048
P8 GC+SHH+1d cultureATGTCTGCTC (2)
CAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
GGCGGCGCTG
TGACTCACCA
400.04
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
TGACTCACCA
80.60.0806
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
54.40.0544
P1 cortexACTTTAAATA (3)
CCTTTAATCC (3)
GAACTTTAAG (4)
163.50.1635
HypothalamusATGTCTGCTC (2)
CCTTTAATCC (3)
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
GGCGGCGCTG
TGTTTAAAAA (2)
37.90.0379
E12.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
TGACTCACCA
TGTTAAAAAA
90.10.0901
E14.5 retinaATGTCTGCTC (2)
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
136.70.1367
E16.5 retinaCAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
GAACTTAAAG
72.40.0724
E18.5 retinaCCTTTAATCC (3)
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
GGCGGCGCTG
TGTTAAAAAA
32.60.0326
P0.5 retinaATGTCTGCTC (2)
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
82.50.0825
P2.5 retinaCAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
GGCGGCGCTG
93.40.0934
P4.5 retinaCAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
TGTTTAAAAA (2)
85.20.0852
P6.5 retinaACTTTAAATA (3)
CAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
TGTTTAAAAA (2)
108.30.1083
P10.5 crx- retinaACTTTAAATA (3)
CAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
TGACTCACCA
109.70.1097
P10.5 crx+ retinaAGAATTTTCG
CAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
TGACTCACCA
TGTTAAAAAA
72.90.0729
Adult retinalCAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
TGACTCACCA
174.10.1741
ONLACTTTAAATA (3)
AGAATTTTCG
CAGACTATAA
CCTTTAATCC (3)
CTCTAACTTG
GAACTTAAAG
GAACTTTAAG (4)
TGACTCACCA
149.30.1493