Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.276381 AI225873EST AI225873 6    30896 
 Mm.276381 Tnpo3transportin 3 6  6 7.2 cM  320938 
 Gene Ontology nucleus | protein transport | receptor activity | transport
 Human Homolog TNPO3[transportin 3]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 111 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGGAGTTCC (4)
CCACACCTCA
GAAGAAATCA (7)
GCCTTAGCAT
GGGTGGGAAG (3)
GTTGTTGCAT
22.80.0228
Cb medulloblastomaAAAATGAAGA (3)
GAAGAAATCA (7)
GTTGTTGCAT
11.50.0115
P8 GC+1d cultureCAGTGCACAC (2)
GAGGGAGCCA (3)
GCCTTAGCAT
GGGTGGGAAG (3)
GTTGTTGCAT
TTGATTTTCT (2)
26.20.0262
P8 GC+SHH+1d cultureCCACACCTCA
CTTTTTTAAA (2)
GCCTTAGCAT
GGGGTGGGGA
GGGTGGGAAG (3)
GTTGTTGCAT
25.80.0258
3T3 fibroblastsCAGGTTGACA (2)
GCCTTAGCAT
GGGTGGGAAG (3)
420.042
E15 cortexGGGTGGGAAG (3)
29.70.0297
P1 cortexCAGGTTGACA (2)
CTTTTTTAAA (2)
GCCTTAGCAT
GGGTGGGAAG (3)
22.60.0226
HypothalamusAAGCAGCCTC (2)
CCACACCTCA
GAAGAAATCA (7)
GAGGGAGCCA (3)
GGGGTGGGGA
GGGTGGGAAG (3)
19.80.0198
E12.5 retinaCAGGTTGACA (2)
CTTTTTTAAA (2)
CTTTTTTAAG (2)
GAAGAAATCA (7)
GGGTGGGAAG (3)
GTTGTTGCAT
35.80.0358
E14.5 retinaCAGTGCACAC (2)
CTTTTTTAAA (2)
GAGGGAGCCA (3)
GGGTGGGAAG (3)
GGGTGGGAGG (2)
23.60.0236
E16.5 retinaCAGTGCACAC (2)
GAGGGAGCCA (3)
GCCTTAGCAT
GGGTGGGAAG (3)
GTTGTTGCAT
27.10.0271
E18.5 retinaAGGGAGTTCC (4)
GAAGAAATCA (7)
GCCTTAGCAT
GGGGTGGGGA
GGGTGGGAAG (3)
GGGTGGGAGG (2)
TTGATTTTCT (2)
19.90.0199
P0.5 retinaAAAATGAAAA
AAAATGAAGA (3)
CTTTTTTAAA (2)
CTTTTTTAAG (2)
GAGGGAGCCA (3)
GCCTTAGCAT
GGGGTGGGGA
GGGTGGGAAG (3)
29.60.0296
P2.5 retinaAAAATGAAGA (3)
CAGGTTGACA (2)
CCACACCTCA
CTTTTTTAAA (2)
CTTTTTTAAG (2)
GAAGAAATCA (7)
GGGGTGGGGA
GGGTGGGAAG (3)
42.50.0425
P4.5 retinaCTTTTTTAAA (2)
GAGGGAGCCA (3)
GCCTTAGCAT
GGGTGGGAAG (3)
GTTGTTGCAT
TTGATTTTCT (2)
23.90.0239
P6.5 retinaCTTTTTTAAA (2)
GAGGGAGCCA (3)
GCCTTAGCAT
GGGTGGGAAG (3)
GGGTGGGAGG (2)
GTTGTTGCAT
33.40.0334
P10.5 crx- retinaAGGGAGTTCC (4)
CTTTTTTAAA (2)
GAAGAAATCA (7)
GGGTGGGAAG (3)
150.015
P10.5 crx+ retinaCAGGTTGACA (2)
CTTTTTTAAG (2)
GAAGAAATCA (7)
GAGGGAGCCA (3)
GGGTGGGAAG (3)
17.20.0172
Adult retinalCAGGTTGACA (2)
CCACACCTCA
GAAGAAATCA (7)
GAGGGAGCCA (3)
GGGTGGGAAG (3)
GTTGTTGCAT
18.60.0186
ONLAAAATGAAAA
CCACACCTCA
CTTTTTTAAA (2)
CTTTTTTAAG (2)
GAAGAAATCA (7)
GAGGGAGCCA (3)
GCCTTAGCAT
GGGGTGGGGA
GGGTGGGAAG (3)
GGGTGGGAGG (2)
30.40.0304