Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.282039	Acly	ATP citrate lyase	11		104112
Mm.282039	A730098H14Rik	RIKEN cDNA A730098H14 gene	11		319932
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 61 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GAACATTTCA (3) TAAGCCAAGG (3) TGCAACAATG (2) TTTGCTTTAA (3) 42.4 0.0424 Cb medulloblastoma GAACATTTCA (3) TGCAACAATG (2) TTTGCTTTAA (3) 16.1 0.0161 P8 GC+1d culture CAGCCGACTT (2) CTCAGGAACT (2) GAACATTTCA (3) TGCAACAATG (2) TGGTGTAGTA (2) TTTGCTTTAA (3) 28.5 0.0285 P8 GC+SHH+1d culture GAACATTTCA (3) TTTGCTTTAA (3) 42.1 0.0421 3T3 fibroblasts TTTGCTTTAA (3) 3.5 0.0035 P1 cortex TTTGCTTTAA (3) 18.2 0.0182 Hypothalamus CTCAGGAACT (2) TAAGCCAAGG (3) TGCAACAATG (2) TTTGCTTTAA (3) 28.9 0.0289 E12.5 retina GAACATTTCA (3) TGGTGTAGTA (2) TTTGCTTTAA (3) 35.7 0.0357 E14.5 retina GAACATTTCA (3) GAAGGCCGAC (2) TGGTGTAGTA (2) TTTGCTTTAA (3) 50.9 0.0509 E16.5 retina CAGCCGACTT (2) GAACATTTCA (3) TAAGCCAAGG (3) TGGTGTAGTA (2) TTTGCTTTAA (3) 61.5 0.0615 E18.5 retina GAACATTTCA (3) TGCAACAATG (2) TTTGCTTTAA (3) 52.7 0.0527 P0.5 retina CTCAGGAACT (2) GAACATTTCA (3) TTTGCTTTAA (3) 21.6 0.0216 P2.5 retina GAACATTTCA (3) GAAGGCCGAC (2) TTTGCTTTAA (3) 47.5 0.0475 P4.5 retina GAAGGCCGAC (2) TTTGCTTTAA (3) 49.6 0.0496 P6.5 retina GAACATTTCA (3) TAAGCCAAGG (3) TTTGCTTTAA (3) 58.4 0.0584 P10.5 crx- retina GAACATTTCA (3) TGCAACAATG (2) TTTGCTTTAA (3) 35.4 0.0354 P10.5 crx+ retina CAGCCGACTT (2) CTCAGGAACT (2) GAACATTTCA (3) GAAGGCCGAC (2) TGCAACAATG (2) TGGTGTAGTA (2) TTTGCTTTAA (3) 49.8 0.0498 Adult retinal TGGTGTAGTA (2) TTTGCTTTAA (3) 9.3 0.0093 ONL GAACATTTCA (3) TTTGCTTTAA (3) 19.1 0.0191