Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.300203 E130009G09RikRIKEN cDNA E130009G09 gene 11    320062 
 Mm.300203 Ssh2slingshot homolog 2 (Drosophila) 11    237860 
 Human Homolog SSH2[slingshot homolog 2 (Drosophila)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 151 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTTTTGTTT (5)
CCACACAGAT (4)
CTAACAGGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
66.90.0669
Cb medulloblastomaAAGGCTTTGG (4)
ATGATAAACT (2)
ATTTTTGTTT (5)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
46.10.0461
P8 GC+1d cultureAAAACAGGAA
AAAACTAAGG (2)
ATTTTTGTTT (5)
CCACAATCTG (4)
CCACACAGAT (4)
GCAGCAAAGA (3)
GTGTTGCTGT (2)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
53.50.0535
P8 GC+SHH+1d cultureAAAACAGGAA
ATTTTTGTTT (5)
CCACACAGAT (4)
CTTTCGGAGA (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
GTGTTGCTGT (2)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
52.80.0528
3T3 fibroblastsAAGGCTTTGG (4)
GAGGCTTTGC (4)
GAGGCTTTGG (10)
GCTTAGAAGT (4)
GTGTTGCTGT (2)
94.60.0946
E15 cortexGAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCTTAGAAGT (4)
108.70.1087
P1 cortexCCACACAGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
59.10.0591
HypothalamusAAGGCTTTGG (4)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
CTTTCGGAGA (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GAGGCTTTGG (10)
TATTAGTCTT (4)
47.10.0471
E12.5 retinaAAAACTAAGG (2)
ATTTTTGTTT (5)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GAGGCTTTGG (10)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
62.20.0622
E14.5 retinaAAAACAGGAA
AAAACTAAGG (2)
AAGGCTTTGG (4)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GCAGCAAAGA (3)
GCTTAGAAGT (4)
GTGTTGCTGT (2)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
47.10.0471
E16.5 retinaAAAACTAAGG (2)
ATTTTTGTTT (5)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCAGCAAAGA (3)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
36.10.0361
E18.5 retinaAAAACTAAGG (2)
AAGGCTTTGG (4)
ATTTTTGTTT (5)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
43.50.0435
P0.5 retinaAAAACAGGAA
AAAACTAAGG (2)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
TATTAGTCTT (4)
23.60.0236
P2.5 retinaAAGGCTTTGG (4)
CCACACAGAT (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
31.70.0317
P4.5 retinaAAAACAGGAA
ATTTTTGTTT (5)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
29.80.0298
P6.5 retinaAAGGCTTTGG (4)
ATTTTTGTTT (5)
CCACACAGAT (4)
GCAGCAAAGA (3)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
36.80.0368
P10.5 crx- retinaAAAACTAAGG (2)
AAGGCTTTGG (4)
ATGATAAACT (2)
ATTTTTGTTT (5)
CCACAATCTG (4)
CCACACAGAT (4)
CTAACAGGAT (4)
GAGGCTTTGC (4)
GATAACTGTG (4)
GCAGCAAAGA (3)
GCTTAGAAGT (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
98.80.0988
P10.5 crx+ retinaATTTTTGTTT (5)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
CTTTCGGAGA (2)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGG (10)
GTGTTGCTGT (2)
TATTAGTCTT (4)
69.10.0691
Adult retinalATGATAAACT (2)
ATTTTTGTTT (5)
CAGAATTAAC (4)
CCACACAGAT (4)
GAAGAAGTAG (3)
GAGGCTTTGC (4)
TATTAGTCTT (4)
TTTGCTCTGG (3)
48.40.0484
ONLATTTTTGTTT (5)
CCACACAGAT (4)
TATTAGTCTT (4)
900.09