Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.334841 AA516637expressed sequence AA516637 8    101955 
 Mm.334841 AA682107expressed sequence AA682107 8    101973 
 Mm.334841 Cdh13cadherin 13 8  8 64.0 cM  12554 
 Gene Ontology calcium ion binding | cell adhesion | extracellular space | homophilic cell adhesion | membrane | plasma membrane | protein binding
 Human Homolog CDH13[cadherin 13, H-cadherin (heart)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 177 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACCCAGGCTG (3)
AGCACCTGGG
ATGGGGAAGT
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GGTGGCTTCC (3)
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
TTTGTGCCAC (4)
TTTTTTTTTT (2)
91.40.0914
Cb medulloblastomaACCCAGGCTG (3)
ATGGGGAAGT
CCTGCGTCCT (3)
CTCATCCGGC (3)
GTAAAAAAAA (2)
GTGTACCTAT
TACACACGCA (4)
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
150.20.1502
P8 GC+1d cultureACCCAGGCTG (3)
AGCAGTCGGA (3)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
143.80.1438
P8 GC+SHH+1d cultureACCCAGGCTG (3)
ACTAGTGCTT (4)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GGAAAAAGGA (2)
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
TACACACGCA (4)
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
168.70.1687
3T3 fibroblastsACCCAGGCTG (3)
ATGGGCAGGT (4)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCATAGCTG (2)
TACACACGCA (4)
94.60.0946
E15 cortexACCCAGGCTG (3)
ATGGGGAAGT
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
GTCATAGCTG (2)
TTTTTTTTTT (2)
73.90.0739
P1 cortexACCCAGGCTG (3)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
TACACACGCA (4)
TCTCCTTTCT
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
67.90.0679
HypothalamusACCCAGGCTG (3)
AGCACCTGGG
CAAAACTCTG (4)
CTCATCCGGC (3)
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
GTGTACCTAT
TACACACGCA (4)
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
135.70.1357
E12.5 retinaACCCAGGCTG (3)
ACTAGTGCTT (4)
ATGGGGAAGT
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
TTTTTTTTTT (2)
65.80.0658
E14.5 retinaATGGGGAAGT
CCTGCGTCCT (3)
GGAAAAAGGA (2)
GGTGGCTTCC (3)
GTAAAAAAAA (2)
TACACACGCA (4)
TCTCCTTTCT
TTTTTTTTTT (2)
123.80.1238
E16.5 retinaACCCAGGCTG (3)
ATGGGGAAGT
CCTGCGTCCT (3)
GTAAAAAAAA (2)
TACACACGCA (4)
TTTTTTTTTT (2)
99.40.0994
E18.5 retinaACCCAGGCTG (3)
ATGGGGAAGT
CAAAACTCTG (4)
CCTGCGTCCT (3)
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
TTTTTTTTTT (2)
214.60.2146
P0.5 retinaACCCAGGCTG (3)
AGCAGTCGGA (3)
ATGGGCAGGT (4)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCATAGCTG (2)
TACACACGCA (4)
TTTTTTTTTT (2)
92.30.0923
P2.5 retinaACCCAGGCTG (3)
CAAAACTCTG (4)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
GTCATAGCTG (2)
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
126.80.1268
P4.5 retinaACCCAGGCTG (3)
ACTAGTGCTT (4)
ATGGGGAAGT
CCTGCGTCCT (3)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
GTCATAGCTG (2)
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
194.20.1942
P6.5 retinaACCCAGGCTG (3)
CCTGCGTCCT (3)
GGTGGCTTCC (3)
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
GTCATAGCTG (2)
GTGTACCTAT
TACACACGCA (4)
TCTCCTTTCT
TTTTTTTTTT (2)
100.20.1002
P10.5 crx- retinaACCCAGGCTG (3)
AGCACCTGGG
AGCAGTCGGA (3)
ATGGGCAGGT (4)
CCTGCGTCCT (3)
CTCATCCGGC (3)
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
TACACACGCA (4)
TCTCCTTTCT
1080.108
P10.5 crx+ retinaACCCAGGCTG (3)
CCTGCGTCCT (3)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
TACACACGCA (4)
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
88.40.0884
Adult retinalACCCAGGCTG (3)
CCTGCGTCCT (3)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
GTCATAGCTG (2)
TGTGGGTAAT (5)
TTTTTTTTTT (2)
650.065
ONLACCCAGGCTG (3)
CTCATCCGGC (3)
CTCTCTGTGG
GTAAAAAAAA (2)
GTCAGTTCTA
GTCATAGCTG (2)
TACACACGCA (4)
TCTCCTTTCT
TGTGGGTAAT (5)
TTTGTGCCAC (4)
TTTTTTTTTT (2)
57.20.0572