Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.38229 D530030D03RikRIKEN cDNA D530030D03 gene 1    78578 
 Mm.38229 E430023H19RikRIKEN cDNA E430023H19 gene 1    98417 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 103 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGGTTGCTGG (369)68.50.0685
P8 Cb GCGTGGCTCAAA (13)9.80.0098
P8 Cb GCACCAGAGCAG (3)4.90.0049
P8 Cb GCAGGAACTGTA (19)1.60.0016
P8 Cb GCTTTCCTTAGG (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGGTTGCTGG (369)113.30.1133
Cb medulloblastomaGTGGCTCAAA (13)6.90.0069
Cb medulloblastomaTTTCCTTAGG (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGTTGCTGG (369)57.10.0571
P8 GC+1d cultureGTGGCTCAAA (13)13.70.0137
P8 GC+1d cultureACCAGAGCAG (3)6.80.0068
P8 GC+1d cultureTTTCCTTAGG (5)5.70.0057
P8 GC+1d cultureCACAAGGGAA (5)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTGCTGG (369)890.089
P8 GC+SHH+1d cultureACCAGAGCAG (3)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureGTGGCTCAAA (13)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureTTTCCTTAGG (5)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureTGGCATCTCT (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTGCTCAAAA (2)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG (369)220.80.2208
3T3 fibroblastsACCAGAGCAG (3)17.50.0175
3T3 fibroblastsCACAAGGGAA (5)140.014
3T3 fibroblastsGTGGCTCAAA (13)10.50.0105
3T3 fibroblastsGCCAAGGCAA (9)3.50.0035
E15 cortexTGGTTGCTGG (369)277.10.2771
E15 cortexGTGGCTCAAA (13)19.80.0198
P1 cortexTGGTTGCTGG (369)86.40.0864
P1 cortexGTGGCTCAAA (13)18.20.0182
P1 cortexTTTCCTTAGG (5)9.10.0091
P1 cortexACCAGAGCAG (3)4.50.0045
P1 cortexAGGAACTGTA (19)4.50.0045
P1 cortexCACAAGGGAA (5)4.50.0045
HypothalamusTGGTTGCTGG (369)349.60.3496
HypothalamusGTGGCTCAAA (13)5.40.0054
E12.5 retinaTGGTTGCTGG (369)157.70.1577
E12.5 retinaGTGGCTCAAA (13)11.30.0113
E12.5 retinaACCAGAGCAG (3)5.60.0056
E12.5 retinaTTTCCTTAGG (5)3.80.0038
E12.5 retinaAGGAACTGTA (19)1.90.0019
E12.5 retinaCACAAGGGAA (5)1.90.0019
E12.5 retinaTGGCATCTCT (3)1.90.0019
E14.5 retinaTGGTTGCTGG (369)936.50.9365
E14.5 retinaGTGGCTCAAA (13)18.20.0182
E14.5 retinaACCAGAGCAG (3)10.90.0109
E14.5 retinaAGGAACTGTA (19)1.80.0018
E14.5 retinaTGGCATCTCT (3)1.80.0018
E16.5 retinaTGGTTGCTGG (369)767.90.7679
E16.5 retinaGTGGCTCAAA (13)9.10.0091
E16.5 retinaACCAGAGCAG (3)7.20.0072
E16.5 retinaTTTCCTTAGG (5)7.20.0072
E18.5 retinaTGGTTGCTGG (369)252.80.2528
E18.5 retinaACCAGAGCAG (3)5.50.0055
E18.5 retinaGTGGCTCAAA (13)5.50.0055
E18.5 retinaAGGAACTGTA (19)1.80.0018
E18.5 retinaGCCAAGGCAA (9)1.80.0018
E18.5 retinaTGGCATCTCT (3)1.80.0018
P0.5 retinaTGGTTGCTGG (369)190.40.1904
P0.5 retinaGTGGCTCAAA (13)17.70.0177
P0.5 retinaACCAGAGCAG (3)5.90.0059
P0.5 retinaTTTCCTTAGG (5)20.002
P2.5 retinaTGGTTGCTGG (369)165.40.1654
P2.5 retinaACCAGAGCAG (3)10.60.0106
P2.5 retinaGTGGCTCAAA (13)10.60.0106
P2.5 retinaAGGAACTGTA (19)3.50.0035
P2.5 retinaTTTCCTTAGG (5)3.50.0035
P2.5 retinaGCCAAGGCAA (9)1.80.0018
P2.5 retinaTGGCATCTCT (3)1.80.0018
P4.5 retinaTGGTTGCTGG (369)150.60.1506
P4.5 retinaACCAGAGCAG (3)11.90.0119
P4.5 retinaGTGGCTCAAA (13)7.90.0079
P4.5 retinaTGGCATCTCT (3)40.004
P4.5 retinaTTTCCTTAGG (5)20.002
P6.5 retinaTGGTTGCTGG (369)156.70.1567
P6.5 retinaGTGGCTCAAA (13)11.70.0117
P6.5 retinaTGGCATCTCT (3)3.30.0033
P6.5 retinaTTTCCTTAGG (5)3.30.0033
P6.5 retinaACCAGAGCAG (3)1.70.0017
P6.5 retinaAGGAACTGTA (19)1.70.0017
P6.5 retinaTTGCTCAAAA (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGTTGCTGG (369)280.50.2805
P10.5 crx- retinaTTTCCTTAGG (5)16.70.0167
P10.5 crx- retinaACCAGAGCAG (3)5.60.0056
P10.5 crx- retinaGTGGCTCAAA (13)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTGGCATCTCT (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCTGG (369)101.90.1019
P10.5 crx+ retinaGTGGCTCAAA (13)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaACCAGAGCAG (3)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaAGGAACTGTA (19)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTTGCTCAAAA (2)1.90.0019
Adult retinalTGGTTGCTGG (369)214.80.2148
Adult retinalACCAGAGCAG (3)11.10.0111
Adult retinalTTTCCTTAGG (5)7.40.0074
Adult retinalCACAAGGGAA (5)1.90.0019
Adult retinalGCCAAGGCAA (9)1.90.0019
Adult retinalGTGGCTCAAA (13)1.90.0019
Adult retinalTGGCATCTCT (3)1.90.0019
ONLTGGTTGCTGG (369)398.40.3984
ONLAGGAACTGTA (19)11.50.0115
ONLTTTCCTTAGG (5)9.60.0096
ONLGTGGCTCAAA (13)5.70.0057
ONLGCCAAGGCAA (9)3.80.0038
ONLACCAGAGCAG (3)1.90.0019
ONLTGGCATCTCT (3)1.90.0019