Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.38229	D530030D03Rik	RIKEN cDNA D530030D03 gene	1		78578
Mm.38229	E430023H19Rik	RIKEN cDNA E430023H19 gene	1		98417
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 103 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 86.4 0.0864 Cb medulloblastoma GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 122.5 0.1225 P8 GC+1d culture ACCAGAGCAG (3) CACAAGGGAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 84.4 0.0844 P8 GC+SHH+1d culture ACCAGAGCAG (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTGCTCAAAA TTTCCTTAGG (4) 111.3 0.1113 3T3 fibroblasts ACCAGAGCAG (3) CACAAGGGAA (3) GCCAAGGCAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG 266.3 0.2663 E15 cortex GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG 296.9 0.2969 P1 cortex ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) CACAAGGGAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 127.2 0.1272 Hypothalamus GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG 355 0.355 E12.5 retina ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) CACAAGGGAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 184.1 0.1841 E14.5 retina ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG 969.2 0.9692 E16.5 retina ACCAGAGCAG (3) GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 791.4 0.7914 E18.5 retina ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) GCCAAGGCAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG 269.2 0.2692 P0.5 retina ACCAGAGCAG (3) GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 216 0.216 P2.5 retina ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) GCCAAGGCAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 197.2 0.1972 P4.5 retina ACCAGAGCAG (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 176.4 0.1764 P6.5 retina ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTGCTCAAAA TTTCCTTAGG (4) 180.1 0.1801 P10.5 crx- retina ACCAGAGCAG (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 308.4 0.3084 P10.5 crx+ retina ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) GTGGCTCAAA (2) TGGTTGCTGG TTGCTCAAAA 121.1 0.1211 Adult retinal ACCAGAGCAG (3) CACAAGGGAA (3) GCCAAGGCAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 240.9 0.2409 ONL ACCAGAGCAG (3) AGGAACTGTA (2) GCCAAGGCAA (3) GTGGCTCAAA (2) TGGCATCTCT (2) TGGTTGCTGG TTTCCTTAGG (4) 432.8 0.4328