Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4269 5730422P05RikRIKEN cDNA 5730422P05 gene 18    67762 
 Mm.4269 Tcf4transcription factor 4 18    21413 
 Mm.4269 4732423E21RikRIKEN cDNA 4732423E21 gene 18    106967 
 Mm.4269 6030446J10RikRIKEN cDNA 6030446J10 gene 18    320848 
 Mm.4269 9630026C02RikRIKEN cDNA 9630026C02 gene 18    320591 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 161 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
AACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTTTGTTT (5)
GATATTACAA (5)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TATTCAGAAA (6)
TGTTACTGAA (5)
TTCTCACCAG (5)
TTGTGCTTGT (5)
115.80.1158
Cb medulloblastomaAAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
GGACTTGAAG (6)
TATTAAGGAA (5)
TTATCATAAA (5)
18.40.0184
P8 GC+1d cultureAAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTGACTTT (7)
CAGCATTGCC (5)
GATATTACAA (5)
GGACAGATGT (5)
GGTTTGTAAA (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TATTAAGGAA (5)
TATTCAGAAA (6)
TCGTTTTCTT (5)
TGATTCGCTG (5)
TGTTACTGAA (5)
TTATCATAAA (5)
TTCTCACCAG (5)
TTGTGCTTGT (5)
102.50.1025
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTGACTTT (7)
CCTGACCAAT (6)
GGACAGATGT (5)
GGTTTGTAAA (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TATTAAGGAA (5)
TCGTTTTCTT (5)
TGATTCGCTG (5)
TGTTACTGAA (5)
TTCTCACCAG (5)
TTGTGCTTGT (5)
900.09
3T3 fibroblastsCCAAGATTGT (6)
GGACAGATGT (5)
TATCAGTGCC (5)
140.014
E15 cortexAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TATCAGTGCC (5)
TGTTACTGAA (5)
74.10.0741
P1 cortexAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
CCAAGATTGT (6)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TATCAGTGCC (5)
TATTAAGGAA (5)
TCGTTTTCTT (5)
TTGTGCTTGT (5)
104.30.1043
HypothalamusAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
7.20.0072
E12.5 retinaAAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATTCAGAAA (6)
TGTTTCCATT (5)
11.40.0114
E14.5 retinaACCGTTCTGT (5)
CAGCATTGCC (5)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
16.40.0164
E16.5 retinaAACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
CCAAGATTGT (6)
GTCAGATTTT (6)
TGTTACTGAA (5)
TGTTTCCATT (5)
23.50.0235
E18.5 retinaAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
CAGCATTGCC (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TGTTACTGAA (5)
32.70.0327
P0.5 retinaAAAAAATTGA (6)
AACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTGACTTT (7)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TGTTACTGAA (5)
TTATCATAAA (5)
25.70.0257
P2.5 retinaAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTTTGTTT (5)
CAGCATTGCC (5)
CCAAGATTGT (6)
GGACAGATGT (5)
GGTTTGTAAA (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TGTTACTGAA (5)
TTGTGCTTGT (5)
51.40.0514
P4.5 retinaAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTTTGTTT (5)
CAGCATTGCC (5)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TCGTTTTCTT (5)
TGTTACTGAA (5)
TTGTGCTTGT (5)
35.90.0359
P6.5 retinaAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
AACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TATCAGTGCC (5)
TTATCATAAA (5)
23.50.0235
P10.5 crx- retinaAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
CCTGACCAAT (6)
TATTCAGAAA (6)
TGTTACTGAA (5)
29.80.0298
P10.5 crx+ retinaAAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
CCTGACCAAT (6)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TATTCAGAAA (6)
TGTTACTGAA (5)
TTGTGCTTGT (5)
40.20.0402
Adult retinalACCGTTCTGT (5)
CCAAGATTGT (6)
CCTGACCAAT (6)
TATCAGTGCC (5)
TTGTGCTTGT (5)
9.50.0095
ONLACCGTTCTGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TTCTCACCAG (5)
7.60.0076