Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.45028 C230060L03RikRIKEN cDNA C230060L03 gene 11    328012 
 Mm.45028 2610002J23RikRIKEN cDNA 2610002J23 gene 11    69886 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 138 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (3)
CTAGGGAAAA (2)
CTGGGCTTGA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTATA (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
TTTCAAAAAA (2)
91.40.0914
Cb medulloblastomaAGCAGAGAGC (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
TTTCAAAAAA (2)
103.90.1039
P8 GC+1d cultureAGCAAGATAG (2)
CCTTTAATCC (3)
CTAGGGAAAA (2)
CTGGGCTTGA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTATA (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
TTTCAAAAAA (2)
69.60.0696
P8 GC+SHH+1d cultureAGCAGAGAGC (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
76.20.0762
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
TGTGCAGATG (2)
73.60.0736
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
98.90.0989
P1 cortexCCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTCAAAAAA (2)
181.70.1817
HypothalamusAGCAAGATAG (2)
CCTTTAATCC (3)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
TTTCAAAAAA (2)
45.10.0451
E12.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TCAACAACAA
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTTTG
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
TTTCAAAAAA (2)
1090.109
E14.5 retinaAGCAGAGAGC (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TCAACAACAA
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTTTG
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
176.60.1766
E16.5 retinaCCTTTAATCC (3)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTCAAAAAA (2)
112.30.1123
E18.5 retinaCCTTTAATCC (3)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTATA (2)
TGTGTGTTTG
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
TTTCAAAAAA (2)
90.90.0909
P0.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
103.90.1039
P2.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
91.60.0916
P4.5 retinaAGCAAGATAG (2)
AGCAGAGAGC (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
99.20.0992
P6.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTAGGGAAAA (2)
CTGGGCTTGA (2)
TCAACAACAA
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
96.60.0966
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTATA (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
85.60.0856
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (3)
CTAGGGAAAA (2)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTTTG
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
710.071
Adult retinalAGCAGAGAGC (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGGGCTTGA (2)
TCAACAACAA
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTTTG
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
168.80.1688
ONLCCTTTAATCC (3)
TCTCAAAAAA (3)
TGTGCAGATG (2)
TGTGTGTATA (2)
TTCAAAAAAA (2)
TTTAAGATAC (3)
TTTCAAAAAA (2)
107.20.1072