Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.45602	Brd8	bromodomain containing 8	18		78656
Mm.45602	4432404P07Rik	RIKEN cDNA 4432404P07 gene	18		70787
Gene Ontology	receptor activity
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 79 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATAACTGAGT (5) CAGACTGTGG (3) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TAGGCCAAAC (2) TATGTGTGCA (3) 48.8 0.0488 Cb medulloblastoma ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) TATGTGTGCA (3) 30 0.03 P8 GC+1d culture ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TAGGCCAAAC (2) TGTGCTCCCA (2) 26.2 0.0262 P8 GC+SHH+1d culture ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) 28.1 0.0281 E15 cortex ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) 29.6 0.0296 P1 cortex ATAACTGAGT (5) GGTTTTGTTA (3) TATGTGTGCA (3) 18.1 0.0181 Hypothalamus ATAACTGAGT (5) CAGACTGTGG (3) GGCTCTGTTA (2) TAGGCCAAAC (2) TATGTGTGCA (3) TGTGCTCCCA (2) 18 0.018 E12.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TAGGCCAAAC (2) TATGTGTGCA (3) TGTGCTCCCA (2) 35.8 0.0358 E14.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) TATGTGTGCA (3) 23.6 0.0236 E16.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) TATGTGTGCA (3) TCATTTGGCC (2) 29 0.029 E18.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) TAGGCCAAAC (2) TATGTGTGCA (3) 14.5 0.0145 P0.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TAGGCCAAAC (2) TATGTGTGCA (3) 25.5 0.0255 P2.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TAGGCCAAAC (2) TATGTGTGCA (3) 35.2 0.0352 P4.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) TATGTGTGCA (3) TCATTTGGCC (2) 27.8 0.0278 P6.5 retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) 21.6 0.0216 P10.5 crx- retina ATAACTGAGT (5) CAGACTGTGG (3) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TATGTGTGCA (3) 26.1 0.0261 P10.5 crx+ retina ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TAGGCCAAAC (2) TATGTGTGCA (3) TGTGCTCCCA (2) 23 0.023 Adult retinal ATAACTGAGT (5) TATGTGTGCA (3) 9.3 0.0093 ONL ATAACTGAGT (5) GGCTCTGTTA (2) GGTTTTGTTA (3) TAGGCCAAAC (2) 9.5 0.0095