Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.45953 C81302expressed sequence C81302 2    97011 
 Mm.45953 Snap25synaptosomal-associated protein 25 2  2 F3 (2 78.2 cM)  20614 
 Gene Ontology neurotransmitter secretion | neurotransmitter secretion | neurotransmitter uptake | plasma membrane | SNARE binding | synaptic transmission | synaptic vesicle docking | synaptosome
 Human Homolog SNAP25[synaptosomal-associated protein, 25kDa]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 81 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGAACCAAA (3)
CTGCAGCTGG (3)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
19.50.0195
Cb medulloblastomaAAAGAAGCAG (3)
AGGAACCAAA (3)
CTCAGTATTG (4)
CTGCAGCTGG (3)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
152.50.1525
P8 GC+1d cultureAGGAACCAAA (3)
CTCAGTATTG (4)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
36.40.0364
P8 GC+SHH+1d cultureAGGAACCAAA (3)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
28.10.0281
3T3 fibroblastsAAAGAAGCAG (3)
3.50.0035
E15 cortexGGAGAAGGCT (5)
4.90.0049
P1 cortexCTGTAATGAT (2)
TATATTAAAT (4)
22.70.0227
HypothalamusAGGAACCAAA (3)
CTCAGTATTG (4)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
146.70.1467
E12.5 retinaAAAGAAGCAG (3)
GGAGAAAGGT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
11.30.0113
E14.5 retinaCTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
16.40.0164
E16.5 retinaGGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
12.70.0127
E18.5 retinaCTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
32.70.0327
P0.5 retinaAGGAACCAAA (3)
CTGCAGCTGG (3)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
100.01
P2.5 retinaAAAGAAGCAG (3)
AGGAACCAAA (3)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
51.10.0511
P4.5 retinaAGGAACCAAA (3)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
33.70.0337
P6.5 retinaAGGAACCAAA (3)
CTCAGTATTG (4)
CTGTAATGAT (2)
GAATTTACCT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
83.40.0834
P10.5 crx- retinaAAAGAAGCAG (3)
AGGAACCAAA (3)
CTGCAGCTGG (3)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAAGGT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
50.40.0504
P10.5 crx+ retinaAGGAACCAAA (3)
CTGCAGCTGG (3)
GAATTTACCT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
36.40.0364
Adult retinalAGGAACCAAA (3)
CTGCAGCTGG (3)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAAGGT (2)
TATATTAAAT (4)
57.40.0574
ONLAGGAACCAAA (3)
CTGTAATGAT (2)
GGAGAAGGCT (5)
TATATTAAAT (4)
40.20.0402