Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.289662 Ddx3xDEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 3, X-linked X  1 7.0 cM  13205 
 Mm.289662 Fin14fibroblast growth factor inducible 14 X  6 42.0 cM  14209 
 Gene Ontology integral to membrane
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 107 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTGGAATGG (3)
CTAGTGTTGA (3)
GCCCCAAATG
GTATTTATAG (3)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TGGTTATCTT (2)
TTTGAGGATT (2)
65.10.0651
Cb medulloblastomaCTAGTGTTGA (3)
GGAATGATAG
GTATTTATAG (3)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTTGAGGATT (2)
27.70.0277
P8 GC+1d cultureACTGGAATGG (3)
GGAATGATAG
GTATTTATAG (3)
TGCTGTGCAT (2)
250.025
P8 GC+SHH+1d cultureACTGGAATGG (3)
GTATTTATAG (3)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TTTGAGGATT (2)
TTTGTGTTGA
43.40.0434
3T3 fibroblastsCACCAGGCAC
CTAGTGTTGA (3)
GCCCCAAATG
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTGCAT (2)
31.50.0315
E15 cortexCTAGTGTTGA (3)
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTGCAT (2)
14.70.0147
P1 cortexACTGGAATGG (3)
CTAGTGTTGA (3)
TGCTGTGCAT (2)
36.40.0364
HypothalamusTAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTTGAGGATT (2)
27.10.0271
E12.5 retinaCTAGTGTTGA (3)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TTTGTGTTGA
58.30.0583
E14.5 retinaCTAGTGTTGA (3)
GTCTCAAAGT
TGCTGTGCAT (2)
TGGTTATCTT (2)
TTTGAGGATT (2)
36.30.0363
E16.5 retinaCTAGTGTTGA (3)
GCCCCAAATG
GTCTCAAAGT
TGCTGTGCAT (2)
TGGTTATCTT (2)
TTTGAGGATT (2)
560.056
E18.5 retinaCTAGTGTTGA (3)
GTATTTATAG (3)
TGCTGTGCAT (2)
TTTGAGGATT (2)
23.60.0236
P0.5 retinaCACCAGGCAC
CTAGTGTTGA (3)
GTCATAGCTG (2)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
43.20.0432
P2.5 retinaCTAGTGTTGA (3)
GTATTTATAG (3)
GTCATAGCTG (2)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTTGAGGATT (2)
68.70.0687
P4.5 retinaCTAGTGTTGA (3)
GTATTTATAG (3)
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
31.80.0318
P6.5 retinaACTGGAATGG (3)
CTAGTGTTGA (3)
GTATTTATAG (3)
GTCATAGCTG (2)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTTGAGGATT (2)
61.70.0617
P10.5 crx- retinaTAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGCAGTGGA (3)
TTTGAGGATT (2)
22.40.0224
P10.5 crx+ retinaCACCAGGCAC
CTAGTGTTGA (3)
GTATTTATAG (3)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TTTGAGGATT (2)
57.60.0576
Adult retinalACTGGAATGG (3)
CACCAGGCAC
GCCCCAAATG
GTCATAGCTG (2)
TAACTTAGCC (2)
TGCTGTGCAT (2)
TGGTTATCTT (2)
28.10.0281
ONLGGAATGATAG
GTCATAGCTG (2)
TGCTGTGCAT (2)
TTTGAGGATT (2)
TTTGTGTTGA
32.50.0325