Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.277585 D16Ium29eDNA segment, Chr 16, Indiana University Medical 29, expressed 16  16 46.3 cM  28180 
 Mm.277585 E030013M08RikRIKEN cDNA E030013M08 gene 16    319425 
 Mm.277585 Appamyloid beta (A4) precursor protein 16  16 56.0 cM  11820 
 Mm.277585 C76493expressed sequence C76493 16    98007 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 124 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATAGCTTTCT (4)
CCACTGAAAA (4)
CTGAAGAAGT (5)
GAAAAAGAAT (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
120.70.1207
Cb medulloblastomaATAGCTTTCT (4)
CTGAAGAAGT (5)
GAAAAAGAAT (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
194.20.1942
P8 GC+1d cultureACTGCATCTT (4)
ACTGCCTCTT (4)
ATAGCTTTCT (4)
ATGGATGGAT (4)
GCATAAGCAA (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
192.80.1928
P8 GC+SHH+1d cultureATAGCTTTCT (4)
ATGGATGGAT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GAAAAAGAAT (4)
GCATAAGCAA (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
148.70.1487
3T3 fibroblastsATAGCTTTCT (4)
GCGTGGTGGA (4)
GTGGACCCCA (6)
10.50.0105
E15 cortexAATGTGCAGA (5)
ATAGCTTTCT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GGGTTGGGGG (4)
GGGTTTTGGG (6)
34.50.0345
P1 cortexATAGCTTTCT (4)
CTGAAGAAGT (5)
CTGCTGCCCT (5)
GCATAAGCAA (4)
GGTTTTGTGT (4)
TATCTTTGGA (4)
81.70.0817
HypothalamusACTGCATCTT (4)
ATAGCTTTCT (4)
CTGAAGAAGT (5)
GCATAAGCAA (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
146.60.1466
E12.5 retinaATAGCTTTCT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GAAAAAGAAT (4)
GCATAAGCAA (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
320.032
E14.5 retinaAATGTGCAGA (5)
ATAGCTTTCT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GCATAAGCAA (4)
GGGTTGGGGG (4)
GGTTTTGTGT (4)
41.80.0418
E16.5 retinaACTGCCTCTT (4)
ATAGCTTTCT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GCGTGGTGGA (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
63.30.0633
E18.5 retinaATAGCTTTCT (4)
ATGGATGGAT (4)
GCATAAGCAA (4)
TATCTTTGGA (4)
27.20.0272
P0.5 retinaACAAAGTTCA (4)
ATAGCTTTCT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GCGTGGTGGA (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
39.40.0394
P2.5 retinaAGAGACTGGG (4)
ATAGCTTTCT (4)
ATAGCTTTTT (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
51.20.0512
P4.5 retinaAGAGACTGGG (4)
ATAGCTTTCT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GCATAAGCAA (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
77.40.0774
P6.5 retinaATAGCTTTCT (4)
CCACTGAAAA (4)
CTGAAGAAGT (5)
GGGTTTTGGG (6)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
30.20.0302
P10.5 crx- retinaACTGCATCTT (4)
ACTGCCTCTT (4)
ATAGCTTTCT (4)
ATAGCTTTTT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GCATAAGCAA (4)
GGTTTTGTGT (4)
57.80.0578
P10.5 crx+ retinaATAGCTTTCT (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
63.50.0635
Adult retinalACTGCCTCTT (4)
ATAGCTTTCT (4)
CTGCTGCCCT (5)
GCATAAGCAA (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
TATCTTTGGA (4)
29.90.0299
ONLAATGTGCAGA (5)
ACAAAGTTCA (4)
AGAGACTGGG (4)
ATAGCTTTCT (4)
CCACTGAAAA (4)
GGGTTGGGGG (4)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGACCCCA (6)
26.70.0267