Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.153895 A930012N16RikRIKEN cDNA A930012N16 gene 2    77813 
 Mm.153895 C79248expressed sequence C79248 2    96982 
 Mm.153895 Rnpc2RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 2 2    170791 
 Mm.153895 B330012G18RikRIKEN cDNA B330012G18 gene 2    320419 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 84 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGAGAAAAAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
TGCTACCTAG (5)
9.80.0098
Cb medulloblastomaAAGAACGTAG (4)
GAGGAGTCAT (4)
GCAGATGGTT (4)
TATAAATAAA (7)
TGCTACCTAG (5)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureAAGAACGTAG (4)
GAGGAGTCAT (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
170.017
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAACGTAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
GTTTTATGGC (5)
14.10.0141
3T3 fibroblastsCCGGGTGGTG (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
TGCTACCTAG (5)
280.028
E15 cortexCCGGGTGGTG (4)
GCCTTCAATA (4)
GTTCAGCAAA (4)
19.70.0197
P1 cortexAAGAACGTAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GCTTCAATAT (5)
GTTCAGCAAA (4)
TGCTACCTAG (5)
45.40.0454
HypothalamusGTTCAGCAAA (4)
GTTTTATGGC (5)
TTAACTGAAG (7)
5.40.0054
E12.5 retinaAAGAACGTAG (4)
AGAGAAAAAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GCCTTCAATA (4)
GTTCAGCAAA (4)
26.40.0264
E14.5 retinaAAGAACGTAG (4)
AGAGAAAAAG (4)
GCTTCAATAT (5)
GTTCAGCAAA (4)
12.70.0127
E16.5 retinaAAGAACGTAG (4)
AGAGAAAAAG (4)
ATGGATAGTG (4)
GAGGAGTCAT (4)
GCAGATGGTT (4)
GCTTCAATAT (5)
TGCTACCTAG (5)
TTAACTGAAG (7)
19.80.0198
E18.5 retinaAAGAACGTAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
TATAAATAAA (7)
10.90.0109
P0.5 retinaAAGAACGTAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
TGTTTAGGTA (4)
41.30.0413
P2.5 retinaAAGAACGTAG (4)
CCGGGTGGTG (4)
GCAGATGGTT (4)
GCTTCAATAT (5)
GTTCAGCAAA (4)
TATAAATAAA (7)
TGTTTAGGTA (4)
26.50.0265
P4.5 retinaAAGAACGTAG (4)
GTTCAGCAAA (4)
21.80.0218
P6.5 retinaAAGAACGTAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
16.70.0167
P10.5 crx- retinaATGGATAGTG (4)
GAGGAGTCAT (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
GTTTTATGGC (5)
37.10.0371
P10.5 crx+ retinaAAGAACGTAG (4)
AGAGAAAAAG (4)
GCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
TATAAATAAA (7)
210.021
Adult retinalGCCTTCAATA (4)
GTTCAGCAAA (4)
16.70.0167
ONLGCAGATGGTT (4)
GTTCAGCAAA (4)
TTAACTGAAG (7)
13.40.0134