Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.213408 D16Ium21eDNA segment, Chr 16, Indiana University Medical 21, expressed 16  16 67.4 cM  28186 
 Mm.213408 Ttc3tetratricopeptide repeat domain 3 16  16 67.9 cM  22129 
 Mm.213408 2610202A04RikRIKEN cDNA 2610202A04 gene 16    70444 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 81 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGCTAAAG (3)
AAGATGAGGG (4)
CAATCTTGTA (3)
CCTTACACTT (4)
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
30.90.0309
Cb medulloblastomaAAAGCTAAAG (3)
CCTTACACTT (4)
TGAACCTTGA (3)
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
25.40.0254
P8 GC+1d cultureCCTTACACTT (4)
TGGCACTGTA (3)
36.60.0366
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTACACTT (4)
TGAACCTTGA (3)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
32.90.0329
3T3 fibroblastsTGAGAACTGC (5)
3.50.0035
E15 cortexCAATCTTGTA (3)
CCTTACACTT (4)
TGAGAACTGC (5)
TTTTGAGTGA (3)
64.20.0642
P1 cortexAAGATGAGGG (4)
CAATCTTGTA (3)
CCTTACACTT (4)
GAAGCTCTCA (4)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
68.10.0681
HypothalamusAAAGCTAAAG (3)
CCTTACACTT (4)
GAAGCTCTCA (4)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
45.30.0453
E12.5 retinaAAAGCTAAAG (3)
CCTTACACTT (4)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
20.70.0207
E14.5 retinaCCTTACACTT (4)
GATGACTTTG (5)
TGGCACTGTA (3)
25.50.0255
E16.5 retinaAAAGCTAAAG (3)
AAGATGAGGG (4)
CCTTACACTT (4)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
36.10.0361
E18.5 retinaCCTTACACTT (4)
GAAGCTCTCA (4)
TGGCACTGTA (3)
21.80.0218
P0.5 retinaCCTTACACTT (4)
GATGACTTTG (5)
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
27.60.0276
P2.5 retinaAAAGCTAAAG (3)
AAGATGAGGG (4)
CACTACACTG (4)
CCTTACACTT (4)
TGAACCTTGA (3)
TGAGAACTGC (5)
TGGCACTGTA (3)
44.20.0442
P4.5 retinaCCTTACACTT (4)
GATGAGTTTG (3)
TGAGAACTGC (5)
23.80.0238
P6.5 retinaCACTACACTG (4)
CCTTACACTT (4)
GATGACTTTG (5)
TGAGAACTGC (5)
TTTTGAGTGA (3)
43.40.0434
P10.5 crx- retinaCCTTACACTT (4)
TGAACCTTGA (3)
TTTTGAGTGA (3)
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaCCTTACACTT (4)
TGGCACTGTA (3)
TTTTGAGTGA (3)
28.80.0288
Adult retinalAAGATGAGGG (4)
CACTACACTG (4)
CCTTACACTT (4)
TGAACCTTGA (3)
TGAGAACTGC (5)
22.40.0224
ONLCCTTACACTT (4)
GATGACTTTG (5)
5.70.0057