Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.21740	Hnrph1	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1	11		59013
Mm.21740	AI642080	expressed sequence AI642080	11		103805
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 86 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGCGGATATG (2) CAGCGGCCAG (2) CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAATT (3) 35.8 0.0358 Cb medulloblastoma CGGGGATTAC (2) TTTGTTAATT (3) 9.2 0.0092 P8 GC+1d culture CGGGGATTAC (2) CTTTTTTGTA (2) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATC (3) TTTGTTAATT (3) 46.8 0.0468 P8 GC+SHH+1d culture CAGCGGCCAG (2) CGGGGATTAC (2) CTTTTTTGTA (2) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATC (3) TTTGTTAATT (3) 30.6 0.0306 3T3 fibroblasts GGCTTGTGTA (3) 3.5 0.0035 E15 cortex TTTGTTAATT (3) 4.9 0.0049 P1 cortex AAACTGACTA (2) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) 40.9 0.0409 Hypothalamus CGGGGATTAC (2) TTTGTTAATT (3) 10.9 0.0109 E12.5 retina AAACTGACTA (2) CAGCGGCCAG (2) CGGGGATTAC (2) GGCTTGTGTA (3) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) 37.6 0.0376 E14.5 retina CAGCGGCCAG (2) CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTTTTTTGTA (2) TTTGTTAATT (3) 45.5 0.0455 E16.5 retina AGCGGATATG (2) CAGCGGCCAG (2) CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTTTTTTGTA (2) GGCTTGTGTA (3) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) 32.5 0.0325 E18.5 retina CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTTTTTTGTA (2) GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAATC (3) TTTGTTAATT (3) 23.6 0.0236 P0.5 retina AAACTGACTA (2) CATCAACAGT (2) GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAATT (3) 25.5 0.0255 P2.5 retina AGCGGATATG (2) CATCAACAGT (2) CGGGGATTAC (2) CTTTTTTGTA (2) GGCTTGTGTA (3) GGTTTGTGTA (2) TTTGTTAATT (3) 52.9 0.0529 P4.5 retina AAACTGACTA (2) CAGCGGCCAG (2) CTTTTTTGTA (2) GGCTTGTGTA (3) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) 35.8 0.0358 P6.5 retina AGCGGATATG (2) CGGGGATTAC (2) GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAATT (3) 28.4 0.0284 P10.5 crx- retina CATCAACAGT (2) GGCTTGTGTA (3) TTTGTTAATT (3) 22.4 0.0224 P10.5 crx+ retina CAGCGGCCAG (2) CGGGGATTAC (2) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) 17.2 0.0172 Adult retinal AGCGGATATG (2) TGTACACAGT (2) TTTGTTAATT (3) 13.1 0.0131 ONL CGGGGATTAC (2) CTTTTTTGTA (2) GGTTTGTGTA (2) TTTGTTAATT (3) 22.9 0.0229