Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.240490 1200009K13RikRIKEN cDNA 1200009K13 gene 6    66870 
 Mm.240490 9330147J08RikRIKEN cDNA 9330147J08 gene 6    320467 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 165 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGAATGCAT (2)
AATACTTTTG (3)
AGCCTCTTCA (2)
CAAAAGCTTT (2)
CTCATTTCCT (2)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
TAAACTTCTG (2)
TAAGCCACCA (2)
TGTGAAAATG (2)
TTCAGATCCC (3)
83.20.0832
Cb medulloblastomaAATACTTTTG (3)
AGTGCTGGGA (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTTAAGGATC (3)
TAAACTTCTG (2)
TAAGCCACCA (2)
TGTCCAGGAC (3)
29.90.0299
P8 GC+1d cultureAAAATAAATT (3)
AAGAATGCAT (2)
AATACTTTTG (3)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
TAAACTTCTG (2)
TGTCCAGGAC (3)
32.90.0329
P8 GC+SHH+1d cultureAAAATAAATT (3)
AATACTTTTG (3)
AGCGACAAAC (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
TAAACTTCTG (2)
TAAGCCACCA (2)
TGTCCAGGAC (3)
45.80.0458
3T3 fibroblastsAGCCTCTTCA (2)
CCTGGGCACC (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
280.028
E15 cortexCCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
34.50.0345
P1 cortexAATACTTTTG (3)
CTCATTTCCT (2)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
40.90.0409
HypothalamusAAAATAAATT (3)
AATACTTTTG (3)
CCTGGGCACC (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
CTTTGTAATC (2)
TGCTAGGAAT (2)
28.90.0289
E12.5 retinaAAGAATGCAT (2)
AATACTTTTG (3)
AGCGACAAAC (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTTGTAATC (2)
TAAACTTCTG (2)
TAAGCCACCA (2)
TTAACTAAAG (2)
80.90.0809
E14.5 retinaAAGAATGCAT (2)
AATACTTTTG (3)
AGCCTCTTCA (2)
AGCGACAAAC (2)
AGTGCTGGGA (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
TAAACTTCTG (2)
TAAGCCACCA (2)
TTAACTAAAG (2)
76.20.0762
E16.5 retinaAAAATAAATT (3)
AATACTTTTG (3)
AGCCTCTTCA (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
TAAACTTCTG (2)
TAAGCCACCA (2)
97.80.0978
E18.5 retinaAATACTTTTG (3)
AGCCTCTTCA (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTTAAGGATC (3)
TAAGCCACCA (2)
TGTCCAGGAC (3)
65.30.0653
P0.5 retinaAAAATAAATT (3)
AAGACAAACG (2)
AATACTTTTG (3)
AGCGACAAAC (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTTAAGGATC (3)
TAAGCCACCA (2)
TTCAGATCCC (3)
49.20.0492
P2.5 retinaAATACTTTTG (3)
AGCCTCTTCA (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
TGTCCAGGAC (3)
440.044
P4.5 retinaAAGAATGCAT (2)
AATACTTTTG (3)
CCTGGGCACC (3)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
TGTGAAAATG (2)
39.70.0397
P6.5 retinaAAGACAAACG (2)
AATACTTTTG (3)
AGCCTCTTCA (2)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
TAAGCCACCA (2)
TGTGAAAATG (2)
41.80.0418
P10.5 crx- retinaAAGACAAACG (2)
AATACTTTTG (3)
CAAAAGCTTT (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTTAAGGATC (3)
CTTCAGGCCA (2)
CTTTGTAATC (2)
TAAACTTCTG (2)
TAAGCCACCA (2)
TTAACTAAAG (2)
37.50.0375
P10.5 crx+ retinaAAGAATGCAT (2)
AAGACAAACG (2)
AATACTTTTG (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTTGTAATC (2)
TAAGCCACCA (2)
26.90.0269
Adult retinalAATACTTTTG (3)
AGTGCTGGGA (2)
CCTGGGCACC (3)
CTCATTTCCT (2)
CTGAAGATTC (3)
CTTAAGGATC (3)
CTTTGTAATC (2)
TTCAGATCCC (3)
24.30.0243
ONLAATACTTTTG (3)
CTTAAGGATC (3)
TGTGAAAATG (2)
TTAACTAAAG (2)
11.40.0114