Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.262053 C76213expressed sequence C76213 4    97124 
 Mm.262053 Vcpvalosin containing protein 4  4 23.0 cM  269523 
 Gene Ontology ATP binding | cell growth and/or maintenance | endoplasmic reticulum | Golgi apparatus | hydrolase activity | lipid binding | nucleotide binding | nucleus | protein binding | transport
 Human Homolog VCP[valosin-containing protein]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 95 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGCGAGCTG (3)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTCTGGAG (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCCCGGGAAT (2)
TTGTAAAAGG (3)
45.70.0457
Cb medulloblastomaCTTTTGAGTT (3)
GCCTCTGGAG (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCTACAAAAA (3)
TTGTAAAAGG (3)
29.90.0299
P8 GC+1d cultureCTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCCCGGGAAT (2)
TTGTAAAAGG (3)
44.40.0444
P8 GC+SHH+1d cultureCAGCGAGCTG (3)
CTGTAAACTC (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCCCGGGAAT (2)
TGATAGTTAT (3)
TTGTAAAAGG (3)
610.061
3T3 fibroblastsGCCTGTTCCA (3)
GTGGCACATC (3)
17.50.0175
E15 cortexCAGCGAGCTG (3)
GCCTCTGGAG (3)
GCCTGTTCCA (3)
TTGTAAAAGG (3)
34.50.0345
P1 cortexCTGTAAACTC (2)
TTGTAAAAGG (3)
27.20.0272
HypothalamusCAGCGAGCTG (3)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCTACAAAAA (3)
TGGTTGGGGA (3)
TTGTAAAAGG (3)
101.30.1013
E12.5 retinaCTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
GTGGCACATC (3)
TTGTAAAAGG (3)
65.80.0658
E14.5 retinaCAGCGAGCTG (3)
CTGGCACATC (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TGATAGTTAT (3)
TGGTTTGGGG (3)
TTGTAAAAGG (3)
490.049
E16.5 retinaCAGCGAGCTG (3)
CTGGCACATC (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCTACAAAAA (3)
TGGTTTGGGG (3)
TTGTAAAAGG (3)
23.40.0234
E18.5 retinaCTGGCACATC (2)
CTGTAAACTC (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TGGTTGGGGA (3)
TTGTAAAAGG (3)
30.80.0308
P0.5 retinaCAGCGAGCTG (3)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTCTGGAG (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCCCGGGAAT (2)
TTGTAAAAGG (3)
33.40.0334
P2.5 retinaCTGGCACATC (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCTACAAAAA (3)
TGGTTGGGGA (3)
TTGTAAAAGG (3)
37.10.0371
P4.5 retinaCTGTAAACTC (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TTGTAAAAGG (3)
65.40.0654
P6.5 retinaCTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TTGTAAAAGG (3)
250.025
P10.5 crx- retinaCTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TTGTAAAAGG (3)
42.70.0427
P10.5 crx+ retinaCTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TGATAGTTAT (3)
TTGTAAAAGG (3)
42.20.0422
Adult retinalAACAGGCAGT (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TCTACAAAAA (3)
TTGTAAAAGG (3)
22.40.0224
ONLCTGTAAACTC (2)
CTTTTGAGTT (3)
GCCTGTTCCA (3)
TTGTAAAAGG (3)
36.40.0364