Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.27330 Smarce1SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 11    57376 
 Mm.27330 5830412H02RikRIKEN cDNA 5830412H02 gene 11    74752 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 126 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTGTCAACCC (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GCAAACAAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
21.20.0212
Cb medulloblastomaGAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GCAAACAAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
230.023
P8 GC+1d cultureCTGTCAACCC (3)
GAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GATGAACAGC (2)
GATGAACGGC (2)
TGAGCATACT (2)
TTGTATCAAC (2)
30.70.0307
P8 GC+SHH+1d cultureCTGTCAACCC (3)
GAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GATGAACAGC (2)
GCAAACAAAA
GGAAGAAAAG
TGAGCATACT (2)
TTGTATCAAC (2)
44.50.0445
3T3 fibroblastsCCCAGCTTCC (2)
CTGTCAACCC (3)
GAGGTGGAAG (2)
GTCATAGCTG (2)
TGAGCATACT (2)
280.028
E15 cortexGAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GTCATAGCTG (2)
TGAGCATACT (2)
44.40.0444
P1 cortexTGAGCATACT (2)
22.70.0227
HypothalamusGAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
TTGTATCAAC (2)
23.40.0234
E12.5 retinaCTGTCAACCC (3)
GAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GATGAACAGC (2)
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
TTGTATCAAC (2)
37.60.0376
E14.5 retinaCTGTCAACCC (3)
GATGAACAGC (2)
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
TTGTATCAAC (2)
21.80.0218
E16.5 retinaCTGTCAACCC (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GATGAACAGC (2)
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
32.60.0326
E18.5 retinaCTGTCAACCC (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GGAAGAAAAG
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
30.90.0309
P0.5 retinaCTGTCAACCC (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GTCATAGCTG (2)
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
39.30.0393
P2.5 retinaCCCAGCTTCC (2)
GAGAAAAGGA (3)
GAGGTGGAAG (2)
GATGAACAGC (2)
GCAAACAAAA
GGAAGAAAAG
GTCATAGCTG (2)
GTGGCCGAAA
TGAGCATACT (2)
390.039
P4.5 retinaCTGTCAACCC (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GCAAACAAAA
GTCATAGCTG (2)
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
47.70.0477
P6.5 retinaGAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GGAAGAAAAG
GTCATAGCTG (2)
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
41.50.0415
P10.5 crx- retinaCTGTCAACCC (3)
GAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
29.80.0298
P10.5 crx+ retinaCCCAGCTTCC (2)
GATGAACGGC (2)
GGAAGAAAAG
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
TTGTATCAAC (2)
32.60.0326
Adult retinalGAGAAAAGGA (3)
GAGAAAGGAG (2)
GAGGTGGAAG (2)
GTCATAGCTG (2)
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
TGAGCATACT (2)
24.30.0243
ONLGAGAAAGGAG (2)
GTCATAGCTG (2)
GTGGCCGAAA
TACACACACA (2)
24.80.0248