Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.288474 Pogzpogo transposable element with ZNF domain 3    229584 
 Mm.288474 Spp1secreted phosphoprotein 1 5  5 56.0 cM  20750 
 Gene Ontology cell adhesion | cytokine activity | extracellular space | ossification | protein binding
 Human Homolog SPP1[secreted phosphoprotein 1 (osteopontin, bone sialoprotein I, early T-lymphocyte activation 1)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 272 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (658)203.90.2039
P8 Cb GCCCCCTCCTGA (4)8.20.0082
P8 Cb GCCCCTCTGTCA (4)8.20.0082
P8 Cb GCTGTGGGAACC (4)6.50.0065
P8 Cb GCGGAAGGAGGG (7)4.90.0049
P8 Cb GCAAGGGCTCTG (5)3.30.0033
P8 Cb GCGGTGGTGCCT (7)3.30.0033
P8 Cb GCAAAAGCAGTG (6)1.60.0016
P8 Cb GCAAGACAAAGT (5)1.60.0016
P8 Cb GCAAGTCCAAGA (6)1.60.0016
P8 Cb GCAGTTCAAGTC (6)1.60.0016
P8 Cb GCCAAACACCGT (6)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (658)797.80.7978
Cb medulloblastomaGGAAGGAGGG (7)13.90.0139
Cb medulloblastomaCCCTCTGTCA (4)11.60.0116
Cb medulloblastomaTGTGGGAACC (4)9.20.0092
Cb medulloblastomaAAAAAAAAGA (7)6.90.0069
Cb medulloblastomaGCCCCTTCTT (6)6.90.0069
Cb medulloblastomaAATTAGAGAA (4)4.60.0046
Cb medulloblastomaAAACAAAAAA (12)2.30.0023
Cb medulloblastomaAAGGGCTCTG (5)2.30.0023
Cb medulloblastomaCCCCTCCTGA (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaCTCACAGAGA (7)2.30.0023
Cb medulloblastomaGCCCTTCTGG (11)2.30.0023
Cb medulloblastomaGGTGGTGCCT (7)2.30.0023
Cb medulloblastomaTAGTAGTGAA (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGGGGACAAA (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (658)204.30.2043
P8 GC+1d cultureTGTGGGAACC (4)13.70.0137
P8 GC+1d cultureAATTAGAGAA (4)5.70.0057
P8 GC+1d cultureCCCCTCCTGA (4)5.70.0057
P8 GC+1d cultureCCCTCTGTCA (4)5.70.0057
P8 GC+1d cultureCAAACACCGT (6)4.60.0046
P8 GC+1d cultureGCCCCTTCTT (6)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGCCCTTCTGG (11)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGGTGGTGCCT (7)3.40.0034
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAGA (7)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGGAAGGAGGG (7)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAGGGCTCTG (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCTCACAGAGA (7)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGCTCACACCT (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (658)278.70.2787
P8 GC+SHH+1d cultureCCCTCTGTCA (4)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGGGAACC (4)8.20.0082
P8 GC+SHH+1d cultureCCCCTCCTGA (4)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureCAAACACCGT (6)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureCAAACACCTT (3)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAGCAGTG (6)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGGTGGTGCCT (7)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAACAAA (15)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGCCCCTTCTT (6)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAGA (7)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAGGGGG (7)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureAATTAGAGAA (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureATTTATGTCT (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCCTCTGATCC (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGCTGGTGGCT (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTCTCCCTGTT (2)1.20.0012
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (658)280.028
3T3 fibroblastsCCCCTCCTGA (4)140.014
3T3 fibroblastsCAAACACCGT (6)10.50.0105
3T3 fibroblastsGGTGGTGCCT (7)10.50.0105
3T3 fibroblastsCCCTCTGTCA (4)3.50.0035
3T3 fibroblastsGCCCCTTCTT (6)3.50.0035
3T3 fibroblastsGGAAGGAGGG (7)3.50.0035
3T3 fibroblastsTGTGGGAACC (4)3.50.0035
E15 cortexAAAAAAAAAA (658)212.80.2128
E15 cortexCCCCTCCTGA (4)9.90.0099
E15 cortexCCCTCTGTCA (4)9.90.0099
E15 cortexGGAAGGAGGG (7)9.90.0099
E15 cortexAAGACAAAGT (5)4.90.0049
E15 cortexGCAACACCGG (4)4.90.0049
E15 cortexGCTGGTGGCT (5)4.90.0049
E15 cortexTGGGGACAAA (5)4.90.0049
P1 cortexAAAAAAAAAA (658)245.40.2454
P1 cortexCCCTCTGTCA (4)9.10.0091
P1 cortexGCCCCTTCTT (6)9.10.0091
P1 cortexAAAAGCAGTG (6)4.50.0045
P1 cortexAATTAGAGAA (4)4.50.0045
P1 cortexCCCCTCCTGA (4)4.50.0045
P1 cortexGGAAGGAGGG (7)4.50.0045
P1 cortexTCTCCCTGTT (2)4.50.0045
P1 cortexTGGGGACAAA (5)4.50.0045
HypothalamusAAAAAAAAAA (658)123.20.1232
HypothalamusTGTGGGAACC (4)18.10.0181
HypothalamusGCCCCTTCTT (6)9.10.0091
HypothalamusCCCTCTGTCA (4)7.20.0072
HypothalamusGCTGGTGGCT (5)7.20.0072
HypothalamusGGTGGTGCCT (7)7.20.0072
HypothalamusGGAAGGAGGG (7)5.40.0054
HypothalamusAATTAGAGAA (4)3.60.0036
HypothalamusGAATTTAAAA (12)3.60.0036
HypothalamusTAGTAGTGAA (4)3.60.0036
HypothalamusAAACAAAAAA (12)1.80.0018
HypothalamusAAGACAAAGT (5)1.80.0018
HypothalamusAATAGAGAAG (3)1.80.0018
HypothalamusCTCACAGAGA (7)1.80.0018
HypothalamusGCTGGTGCCC (2)1.80.0018
HypothalamusTCTCCCTGTT (2)1.80.0018
HypothalamusTGGGGACAAA (5)1.80.0018
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (658)138.90.1389
E12.5 retinaCCCCTCCTGA (4)11.30.0113
E12.5 retinaGGTGGTGCCT (7)9.40.0094
E12.5 retinaAATTAGAGAA (4)7.50.0075
E12.5 retinaGGAAGGAGGG (7)5.60.0056
E12.5 retinaAAAAAAAAGA (7)1.90.0019
E12.5 retinaAAAAAGGGGG (7)1.90.0019
E12.5 retinaAAACAAAAGA (8)1.90.0019
E12.5 retinaCAAACACCTT (3)1.90.0019
E12.5 retinaGCTCACACCT (4)1.90.0019
E12.5 retinaGCTGGTGGCT (5)1.90.0019
E12.5 retinaTAGTAGTGAA (4)1.90.0019
E12.5 retinaTGGGGACAAA (5)1.90.0019
E12.5 retinaTGTGGGAACC (4)1.90.0019
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (658)94.70.0947
E14.5 retinaGCTGGTGGCT (5)16.40.0164
E14.5 retinaCCCCTCCTGA (4)5.50.0055
E14.5 retinaGGTGGTGCCT (7)5.50.0055
E14.5 retinaAAAAAAAAGA (7)3.60.0036
E14.5 retinaGGAAGGAGGG (7)3.60.0036
E14.5 retinaTGTGGGAACC (4)3.60.0036
E14.5 retinaAAACAAAAAA (12)1.80.0018
E14.5 retinaAAACAAAAGA (8)1.80.0018
E14.5 retinaAAGTCCAAGA (6)1.80.0018
E14.5 retinaAATAGAGAAG (3)1.80.0018
E14.5 retinaAGTTCAAGTC (6)1.80.0018
E14.5 retinaCTCACAGAGA (7)1.80.0018
E14.5 retinaTAGTAGTGAA (4)1.80.0018
E14.5 retinaTATGTAGAAA (5)1.80.0018
E14.5 retinaTCTCCCTGTT (2)1.80.0018
E14.5 retinaTGGGGACAAA (5)1.80.0018
E14.5 retinaTTGCTCAGGT (4)1.80.0018
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (658)43.50.0435
E16.5 retinaGCTGGTGGCT (5)18.10.0181
E16.5 retinaAATAGAGAAG (3)3.60.0036
E16.5 retinaCCCTCTGTCA (4)3.60.0036
E16.5 retinaGGAAGGAGGG (7)3.60.0036
E16.5 retinaGGTGGTGCCT (7)3.60.0036
E16.5 retinaTGTGGGAACC (4)3.60.0036
E16.5 retinaAAAAAGGGGG (7)1.80.0018
E16.5 retinaAATTAGAGAA (4)1.80.0018
E16.5 retinaCCCCTCCTGA (4)1.80.0018
E16.5 retinaCTCACAGAGA (7)1.80.0018
E16.5 retinaGCAACACCGG (4)1.80.0018
E16.5 retinaGCCCCTTCTT (6)1.80.0018
E16.5 retinaTGGGGACAAA (5)1.80.0018
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (658)374.70.3747
E18.5 retinaAATTAGAGAA (4)9.10.0091
E18.5 retinaGGAAGGAGGG (7)9.10.0091
E18.5 retinaCCCCTCCTGA (4)5.50.0055
E18.5 retinaTGTGGGAACC (4)5.50.0055
E18.5 retinaAAACAAAAAA (12)3.60.0036
E18.5 retinaCCCTCTGTCA (4)3.60.0036
E18.5 retinaGCCCCTTCTT (6)3.60.0036
E18.5 retinaTGGGGACAAA (5)3.60.0036
E18.5 retinaAAAAAACAAA (15)1.80.0018
E18.5 retinaAAACAAAAGA (8)1.80.0018
E18.5 retinaGAATTTAAAA (12)1.80.0018
E18.5 retinaGCTGGTGCCC (2)1.80.0018
E18.5 retinaGCTGGTGGCT (5)1.80.0018
E18.5 retinaGGTGGTGCCT (7)1.80.0018
E18.5 retinaTATGTAGAAA (5)1.80.0018
E18.5 retinaTCTCCCTGTT (2)1.80.0018
E18.5 retinaTTGCTCAGGT (4)1.80.0018
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (658)117.80.1178
P0.5 retinaCCCCTCCTGA (4)15.70.0157
P0.5 retinaCCCTCTGTCA (4)9.80.0098
P0.5 retinaGGAAGGAGGG (7)5.90.0059
P0.5 retinaAAAAAAAAGA (7)3.90.0039
P0.5 retinaAATTAGAGAA (4)3.90.0039
P0.5 retinaCTCACAGAGA (7)3.90.0039
P0.5 retinaGCCCCTTCTT (6)3.90.0039
P0.5 retinaTGTGGGAACC (4)3.90.0039
P0.5 retinaAAAAGCAGTG (6)20.002
P0.5 retinaAAGGGCTCTG (5)20.002
P0.5 retinaATTTATGTCT (4)20.002
P0.5 retinaCCTCTGATCC (2)20.002
P0.5 retinaGCTGGTGGCT (5)20.002
P0.5 retinaTAGTAGTGAA (4)20.002
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (658)329.10.3291
P2.5 retinaGGAAGGAGGG (7)12.30.0123
P2.5 retinaCCCTCTGTCA (4)10.60.0106
P2.5 retinaTAGTAGTGAA (4)8.80.0088
P2.5 retinaTGTGGGAACC (4)70.007
P2.5 retinaAAAAAAAAGA (7)3.50.0035
P2.5 retinaAAGGGCTCTG (5)3.50.0035
P2.5 retinaAATTAGAGAA (4)3.50.0035
P2.5 retinaAGTTCAAGTC (6)3.50.0035
P2.5 retinaAAAAAGGGGG (7)1.80.0018
P2.5 retinaAAACAAAAAA (12)1.80.0018
P2.5 retinaCAAACACCTT (3)1.80.0018
P2.5 retinaCCCCTCCTGA (4)1.80.0018
P2.5 retinaCCTCTGATCC (2)1.80.0018
P2.5 retinaGCCCCTTCTT (6)1.80.0018
P2.5 retinaGGTGGTGCCT (7)1.80.0018
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (658)283.30.2833
P4.5 retinaGGAAGGAGGG (7)27.70.0277
P4.5 retinaTGTGGGAACC (4)13.90.0139
P4.5 retinaCCCCTCCTGA (4)7.90.0079
P4.5 retinaCCCTCTGTCA (4)7.90.0079
P4.5 retinaAAACAAAAAA (12)20.002
P4.5 retinaAATTAGAGAA (4)20.002
P4.5 retinaATTTATGTCT (4)20.002
P4.5 retinaGAATTTAAAA (12)20.002
P4.5 retinaGCCCCTTCTT (6)20.002
P4.5 retinaGCTGGTGCCC (2)20.002
P4.5 retinaTAGTAGTGAA (4)20.002
P4.5 retinaTGGGGACAAA (5)20.002
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (658)266.80.2668
P6.5 retinaGGAAGGAGGG (7)150.015
P6.5 retinaTGTGGGAACC (4)6.70.0067
P6.5 retinaAATTAGAGAA (4)50.005
P6.5 retinaCCCTCTGTCA (4)50.005
P6.5 retinaGCCCTTCTGG (11)50.005
P6.5 retinaAAACAACAAA (3)3.30.0033
P6.5 retinaAAAAAAAAGA (7)1.70.0017
P6.5 retinaAAAAAACAAA (15)1.70.0017
P6.5 retinaCCCCTCCTGA (4)1.70.0017
P6.5 retinaCCTCTGATCC (2)1.70.0017
P6.5 retinaGAATTTAAAA (12)1.70.0017
P6.5 retinaGCTCACACCT (4)1.70.0017
P6.5 retinaGGTGGTGCCT (7)1.70.0017
P6.5 retinaTAGTAGTGAA (4)1.70.0017
P6.5 retinaTGGGGACAAA (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (658)44.60.0446
P10.5 crx- retinaCCCCTCCTGA (4)130.013
P10.5 crx- retinaCCCTCTGTCA (4)9.30.0093
P10.5 crx- retinaTGTGGGAACC (4)7.40.0074
P10.5 crx- retinaGCCCTTCTGG (11)5.60.0056
P10.5 crx- retinaGGAAGGAGGG (7)5.60.0056
P10.5 crx- retinaAATTAGAGAA (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaCAAACACCGT (6)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGCTGGTGGCT (5)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGGTGGTGCCT (7)3.70.0037
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAGA (7)1.90.0019
P10.5 crx- retinaAAAAGCAGTG (6)1.90.0019
P10.5 crx- retinaAATAGAGAAG (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaATTTATGTCT (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCTCACAGAGA (7)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGAATTTAAAA (12)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGCAACACCGG (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTAGTAGTGAA (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTATGTAGAAA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (658)96.10.0961
P10.5 crx+ retinaGGAAGGAGGG (7)19.20.0192
P10.5 crx+ retinaCCCTCTGTCA (4)13.50.0135
P10.5 crx+ retinaCCCCTCCTGA (4)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaTGTGGGAACC (4)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAGA (7)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCCCTTCTGG (11)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTAGTAGTGAA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTCTCCCTGTT (2)1.90.0019
Adult retinalAAAAAAAAAA (658)57.40.0574
Adult retinalCAAACACCGT (6)7.40.0074
Adult retinalGCCCTTCTGG (11)7.40.0074
Adult retinalGGAAGGAGGG (7)7.40.0074
Adult retinalCCCTCTGTCA (4)5.60.0056
Adult retinalAGTTCAAGTC (6)3.70.0037
Adult retinalGCTGGTGGCT (5)1.90.0019
Adult retinalTGTGGGAACC (4)1.90.0019
ONLAAAAAAAAAA (658)103.40.1034
ONLGGAAGGAGGG (7)7.70.0077
ONLGGTGGTGCCT (7)5.70.0057
ONLCCCTCTGTCA (4)3.80.0038
ONLAAAAAACAAA (15)1.90.0019
ONLAAGTCCAAGA (6)1.90.0019
ONLAATTAGAGAA (4)1.90.0019
ONLCCCCTCCTGA (4)1.90.0019
ONLCCTCTGATCC (2)1.90.0019
ONLGCCCTTCTGG (11)1.90.0019
ONLTGTGGGAACC (4)1.90.0019
ONLTTGCTCAGGT (4)1.90.0019