Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.288474 Pogzpogo transposable element with ZNF domain 3    229584 
 Mm.288474 Spp1secreted phosphoprotein 1 5  5 56.0 cM  20750 
 Gene Ontology cell adhesion | cytokine activity | extracellular space | ossification | protein binding
 Human Homolog SPP1[secreted phosphoprotein 1 (osteopontin, bone sialoprotein I, early T-lymphocyte activation 1)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 62 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCCCTCCTGA (3)8.20.0082
P8 Cb GCAGTTCAAGTC (3)1.60.0016
P8 Cb GCCAAACACCGT (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAACAAAAAA (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaCCCCTCCTGA (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCCCTCCTGA (3)5.70.0057
P8 GC+1d cultureCAAACACCGT (3)4.60.0046
P8 GC+SHH+1d cultureCCCCTCCTGA (3)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureCAAACACCGT (3)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureCAAACACCTT (2)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureCCTCTGATCC (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGCTGGTGGCT (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsCCCCTCCTGA (3)140.014
3T3 fibroblastsCAAACACCGT (3)10.50.0105
E15 cortexCCCCTCCTGA (3)9.90.0099
E15 cortexGCTGGTGGCT (3)4.90.0049
P1 cortexCCCCTCCTGA (3)4.50.0045
HypothalamusGCTGGTGGCT (3)7.20.0072
HypothalamusAAACAAAAAA (3)1.80.0018
HypothalamusGCTGGTGCCC (2)1.80.0018
E12.5 retinaCCCCTCCTGA (3)11.30.0113
E12.5 retinaAAACAAAAGA (2)1.90.0019
E12.5 retinaCAAACACCTT (2)1.90.0019
E12.5 retinaGCTGGTGGCT (3)1.90.0019
E14.5 retinaGCTGGTGGCT (3)16.40.0164
E14.5 retinaCCCCTCCTGA (3)5.50.0055
E14.5 retinaAAACAAAAAA (3)1.80.0018
E14.5 retinaAAACAAAAGA (2)1.80.0018
E14.5 retinaAGTTCAAGTC (3)1.80.0018
E14.5 retinaTATGTAGAAA (4)1.80.0018
E16.5 retinaGCTGGTGGCT (3)18.10.0181
E16.5 retinaCCCCTCCTGA (3)1.80.0018
E18.5 retinaCCCCTCCTGA (3)5.50.0055
E18.5 retinaAAACAAAAAA (3)3.60.0036
E18.5 retinaAAACAAAAGA (2)1.80.0018
E18.5 retinaGCTGGTGCCC (2)1.80.0018
E18.5 retinaGCTGGTGGCT (3)1.80.0018
E18.5 retinaTATGTAGAAA (4)1.80.0018
P0.5 retinaCCCCTCCTGA (3)15.70.0157
P0.5 retinaCCTCTGATCC (2)20.002
P0.5 retinaGCTGGTGGCT (3)20.002
P2.5 retinaAGTTCAAGTC (3)3.50.0035
P2.5 retinaAAACAAAAAA (3)1.80.0018
P2.5 retinaCAAACACCTT (2)1.80.0018
P2.5 retinaCCCCTCCTGA (3)1.80.0018
P2.5 retinaCCTCTGATCC (2)1.80.0018
P4.5 retinaCCCCTCCTGA (3)7.90.0079
P4.5 retinaAAACAAAAAA (3)20.002
P4.5 retinaGCTGGTGCCC (2)20.002
P6.5 retinaAAACAACAAA (2)3.30.0033
P6.5 retinaCCCCTCCTGA (3)1.70.0017
P6.5 retinaCCTCTGATCC (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCCCCTCCTGA (3)130.013
P10.5 crx- retinaCAAACACCGT (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGCTGGTGGCT (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTATGTAGAAA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCCCTCCTGA (3)9.60.0096
Adult retinalCAAACACCGT (3)7.40.0074
Adult retinalAGTTCAAGTC (3)3.70.0037
Adult retinalGCTGGTGGCT (3)1.90.0019
ONLCCCCTCCTGA (3)1.90.0019
ONLCCTCTGATCC (2)1.90.0019