Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.345134	Bscl2	Bernardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 homolog (human)	19	19 4.0 cM	14705
Gene Ontology	integral to membrane
Human Homolog	BSCL2[Bernardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 (seipin)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 158 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAGCTGAATC AGGGAATCTG CTGCTTTCCC (2) CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GGGGTTAAGA (2) TGGTGTTTGT (5) 27.7 0.0277 Cb medulloblastoma AGGGAATCTG GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCTGGGGTAC GGGGTTAAGA (2) TGGTGTTTGT (5) TGTGCGAGAG 43.8 0.0438 P8 GC+1d culture ACCTGCGCCT AGGAAGAGAA (2) AGGGAATCTG GAGAATGGCA (2) GAGAGGAGGA (3) GAGCCTGTAA (4) GGCAAAAAGT GGCTGGGAGG (2) GGGGTTAAGA (2) TGTGCGAGAG 37.4 0.0374 P8 GC+SHH+1d culture AAGCTGAATC AGGGAATCTG CTGTTCCCCT (3) GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCTGGGGTAC GGCAAAAAGT GGCTGGGAGG (2) GGTCAGAGAG TGTGCGAGAG 32.7 0.0327 3T3 fibroblasts ACCTGCGCCT AGGGAATCTG GAGCCTGTAA (4) TTGTGGTAGG 24.5 0.0245 E15 cortex AGGGAATCTG GAGAGGAGGA (3) GAGCCTGTAA (4) TGTGCGAGAG 29.6 0.0296 P1 cortex ACCTGCGCCT AGGAAGAGAA (2) AGGGAATCTG CTGCTTTCCC (2) CTGTTCCCCT (3) GAGCCTGTAA (4) GGTCAGAGAG TTGTGGTAGG 40.6 0.0406 Hypothalamus CTGCTTTCCC (2) CTGTTCCCCT (3) GAGAATGGCA (2) GCTGGGGTAC GGCAAAAAGT GGGGTTAAGA (2) GGTCAGAGAG TCCTTTGCAA 32.5 0.0325 E12.5 retina AACTGATCTT AGGGAATCTG CCACTTAACT CTGCTTTCCC (2) CTGTTCCCCT (3) CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GGCTGGGAGG (2) GGGGTTAAGA (2) TGTGCGAGAG 32.1 0.0321 E14.5 retina AACTGATCTT AGGGAATCTG CCACTTAACT CTGTTCCCCT (3) CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GAGAGGAGGA (3) GGGGTTAAGA (2) TGTGCGAGAG 19.8 0.0198 E16.5 retina AACTGATCTT AGGGAATCTG CTGCTTTCCC (2) CTGTTCCCCT (3) CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GCTGGGGTAC TGTGCGAGAG 25.2 0.0252 E18.5 retina AGGGAATCTG CTGCTTTCCC (2) CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCTGGGGTAC GGGGTTAAGA (2) GGTCAGAGAG 41.9 0.0419 P0.5 retina ACCTGCGCCT AGGGAATCTG CTGTTCCCCT (3) CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCCAAGGGTA (3) GCTGGGGTAC GGCTGGGAGG (2) GGTCAGAGAG TGTGCGAGAG 49.1 0.0491 P2.5 retina AAGCTGAATC AGGGAATCTG CTGCTTTCCC (2) CTGTTCCCCT (3) CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCTGGGGTAC GGGGTTAAGA (2) TGGTGTTTGT (5) TGTGCGAGAG 47.7 0.0477 P4.5 retina AGGGAATCTG CTTTTCTTAT (2) GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCCAAGGGTA (3) GGGGTTAAGA (2) 43.6 0.0436 P6.5 retina AGGAAGAGAA (2) AGGGAATCTG GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCTGGGGTAC GGCAAAAAGT GGCTGGGAGG (2) TCCTTTGCAA TGTGCGAGAG 33.5 0.0335 P10.5 crx- retina AGGGAATCTG GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCTGGGGTAC TCCTTTGCAA TGTGCGAGAG 18.7 0.0187 P10.5 crx+ retina AAGCTGAATC GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GGCTGGGAGG (2) TGTGCGAGAG 19.2 0.0192 Adult retinal ACCTGCGCCT AGGGAATCTG CCACTTAACT CTGCTTTCCC (2) GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GGGGTTAAGA (2) TCCTTTGCAA 29.8 0.0298 ONL AAGCTGAATC AGGGAATCTG CCACTTAACT GAGAATGGCA (2) GAGCCTGTAA (4) GCCAAGGGTA (3) GCTGGGGTAC TGTGCGAGAG 47.7 0.0477