Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.18516	H3f3b	H3 histone, family 3B	11	11 E2	15081
Gene Ontology	chromosome | DNA binding | nucleosome | nucleus
Human Homolog	H3F3B[H3 histone, family 3B (H3.3B)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 5 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 297 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAGCAAAA AAAAGCAAGA (2) AAAATACAAA (2) AATCAAGAAA ATGGTGACTC CCCAAAGACA CCCAAGGACA (3) GCCTCCTGGG (4) GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) TGGTAGAATG TTCACTAACC TTCTGGTGGT (3) TTTAATTCAC TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 202.1 0.2021 Cb medulloblastoma AAAAGCAAAA AAAATACAAA (2) GAATTTGGGG GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) TGTCTGTATG TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG 103.8 0.1038 P8 GC+1d culture AAAAGCAAAA AAAAGCAAGA (2) AAAATACAAA (2) ATGGTGACTC CCCAAAGACA GCCTCCTGGG (4) GGAGTAAGAA GGAGTAAGGA (2) GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) TGGTAGAATG TTAATTAAGT TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 257.9 0.2579 P8 GC+SHH+1d culture AAAAGCAAAA AAAAGCAAGA (2) AAAAGGAAAA (2) AAAATACAAA (2) ATGGTGACTC CCCAAAGACA CCCAAGGACA (3) GAATTTGGGG GCCTCCTGGG (4) GGAGTAAGAA GGAGTAAGGA (2) GGCTCCCCAG (2) GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) GTTTCTGCAT (2) GTTTTAGAAT TGGTAGAATG TTAATTAAGT TTCACTAACC TTCCTGTATG TTCTGGTGGT (3) TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTTTAATAT 257.9 0.2579 3T3 fibroblasts ATGGTGACTC CCCAAGGACA (3) GCCTCCTGGG (4) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTCATAGCTG (2) TTTCTGTATG 45.5 0.0455 E15 cortex GAATTTGGGG GCCTCCTGGG (4) GCTGCCCTTA GGAGTAAGAA GTCATAGCTG (2) 24.5 0.0245 P1 cortex AAAAGCAAGA (2) GCTGCCCTTA GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG TGGTAGAATG TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 81.6 0.0816 Hypothalamus AAAAGCAAGA (2) AAAATACAAA (2) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) TTCACTAACC TTCTGGTGGT (3) TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTTTGTATG 52.4 0.0524 E12.5 retina AAAAGCAAAA AAAAGCAAGA (2) ATGATGAGGA ATGGTGACTC CCCAAAGACA CCCAAGGACA (3) GCCTCCTGGG (4) GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) GTTTTAGAAT TGGTAGAATG TTAATTAAGT TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG 176.7 0.1767 E14.5 retina AAAAGCAAGA (2) AAAAGGAAAA (2) ATGGTGACTC CCCAAAGACA CCCAAGGACA (3) GAATTTGGGG GCCTCCTGGG (4) GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) TTAATTAAGT TTCACTAACC TTTAATTCAC TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 158.3 0.1583 E16.5 retina AAAAGCAAGA (2) AATCAAGAAA ATGGTGACTC CCCAAAGACA GCCTCCTGGG (4) GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGAGTAAGAC GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) GTTTTAGAAT TTTAATTCAC TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 213.6 0.2136 E18.5 retina AAAAGCAAGA (2) ATGATGAGGA ATGGTGACTC CCCAAGGACA (3) GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGAGTAAGAC GGCTCCCCAG (2) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) GTTTTAGAAT TGTCTGTATG TTAATTAAGT TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 141.6 0.1416 P0.5 retina AAAAGCAAAA AAAAGCAAGA (2) AATCAAGAAA ATGATGAGGA ATGGTGACTC CCCAAAGACA GCCTCCTGGG (4) GGAGTAAGAA GGAGTAAGGA (2) GGCTCCCCAG (2) GGTCACACTA (3) GTCATAGCTG (2) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) GTTTTAGAAT TGTCTGTATG TTAATTAAGT TTCCTGTATG TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) TTTTTGTATG 288.8 0.2888 P2.5 retina AAAAGCAAGA (2) CCCAAAGACA CCCAAGGACA (3) GCCTCCTGGG (4) GCTGCCCTTA GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTCATAGCTG (2) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) TGGTAGAATG TTAATTAAGT TTCACTAACC TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) TTTTTAATAT 236.1 0.2361 P4.5 retina AAAAGCAAGA (2) AAAATACAAA (2) CCCAAAGACA CCCAAGGACA (3) GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGAGTAAGAC GTCATAGCTG (2) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) GTTTCTGCAT (2) TGGTAGAATG TTAATTAAGT TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTTTAATAT 164.6 0.1646 P6.5 retina AAAAGCAAGA (2) ATGGTGACTC CCCAAAGACA GAATTTGGGG GCCTCCTGGG (4) GCTGCCCTTA GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTCATAGCTG (2) GTTGTCTTTG TGGTAGAATG TTCACTAACC TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 280.1 0.2801 P10.5 crx- retina AAAAGCAAGA (2) CACAAAGACA (2) CCCAAAGACA GCCTCCTGGG (4) GGAGTAAGAA GGAGTAAGAC GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG GTTTATTAAA (2) TGGTAGAATG TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 277.1 0.2771 P10.5 crx+ retina AAAAGCAAGA (2) AAAATACAAA (2) CACAAAGACA (2) CCCAAAGACA GCCTCCTGGG (4) GGAAGAGGGA (2) GGAGTAAGAA GGCTCCCCAG (2) GGTCACACTA (3) GTTGTCTTTG TGGTAGAATG TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG 151.7 0.1517 Adult retinal AAAAGCAAGA (2) ATGGTGACTC CACAAAGACA (2) CCCAAAGACA CCCAAGGACA (3) GAATTTGGGG GCCTCCTGGG (4) GGAGTAAGAA GGAGTAAGAC GGTCACACTA (3) GTCATAGCTG (2) GTTGTCTTTG TGGTAGAATG TTTCTGTATG 124.6 0.1246 ONL AAAAGCAAGA (2) AAAAGGAAAA (2) CACAAAGACA (2) CCCAAAGACA GCCTCCTGGG (4) GGAGTAAGAA GGTCACACTA (3) GTCATAGCTG (2) GTTGTCTTTG GTTTCTGCAT (2) TTCACTAACC TTCCTGTATG TTCTGGTGGT (3) TTTATAAACT (2) TTTCTGTATG TTTCTTGTTT (2) 122.4 0.1224